More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1052 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 118 aa  244  2e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 110 aa  95.5  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  43.14 
 
 		 109 aa  94.4  5e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1892  MerR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 110 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1445  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 112 aa  85.9  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.236755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  35.19 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2379  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0580  hypothetical protein  38.61 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  40.95 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1199  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1633  hypothetical protein  45.83 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1288  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0650  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00809015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3922  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.856583  normal  0.167239 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 113 aa  67  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0772  hypothetical protein  37.11 
 
 		 193 aa  67  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 173 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  41.98 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1148  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  37.25 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0779  hypothetical protein  37.11 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  31.52 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3966  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.200799  normal  0.0248998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  34.65 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2516  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  31.07 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1409  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.783915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0831  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.087298  normal  0.0939438 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3377  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1588  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1914  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4387  MerR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 757 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0640  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  62  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0887  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0416797  hitchhiker  0.00000266118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 118 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2610  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1268  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.194356 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2925  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00455933  hitchhiker  0.00151967 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2056  regulatory protein MerR  33.75 
 
 		 165 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.880106  normal  0.300945 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  31.07 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  33.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  31.07 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4629  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00782953  normal  0.030329 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2017  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0912  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 840 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  36.23 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2678  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00961924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  30.1 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0082  MerR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1521  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0401274  normal  0.779885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1722  hypothetical protein  36 
 
 		 245 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2652  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00282985  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  43.66 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  36.23 
 
 		 118 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2688  regulatory protein, MerR  38.67 
 
 		 229 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6232  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0163  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>