204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0082 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0082  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 105 aa  213  9.999999999999999e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2364  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1259  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1457  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1089  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1898  MerR family regulatory protein  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1889  transcriptional regulator, MerR family  34.34 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000504717  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1532  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0196  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1719  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1742  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0970  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1551  MerR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.724017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0494  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0739492  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2798  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1147  MerR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0571667  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1660  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2013  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 120 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1313  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1014  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1752  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0206721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01390  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1772  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328935  normal  0.318397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0434  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2092  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 118 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.681298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1459  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2588  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1000  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.861508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1482  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.858746  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1406  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0919  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1366  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1282  MerR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1418  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000205103  normal  0.491097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1996  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000181748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4622  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1378  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0815083  normal  0.541754 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1416  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0849625  normal  0.242004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1455  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2393  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0836  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2109  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.208629  normal  0.127157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0761  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0874748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2852  MerR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2749  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2670  regulatory protein, MerR  40.62 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.988026 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2607  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3018  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2236  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2223  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000299442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1997  transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  28.43 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1938  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1343  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1167  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354578  normal  0.670626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1640  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402978  normal  0.373133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1881  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.027165 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0483  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1974  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1970  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1584  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1584  putative transcription regulator protein  40.62 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4609  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.401376  normal  0.0601167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2054  MerR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3558  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.994671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1983  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00884217  normal  0.359201 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2169  regulatory protein, MerR  40.62 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1425  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000104332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28730  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000134436  hitchhiker  0.00000000749265 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0713  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.245561  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2511  hypothetical protein  40.62 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1471  transcriptional regulator domain-containing protein  36.99 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.22835  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1408  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00332069  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1052  transcriptional regulator, putative  28.28 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.019007 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1705  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0444  transcriptional regulator, MerR family  31 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2385  transcriptional regulator, putative  40.62 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170009  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2633  MerR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 123 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2382  transcriptional regulator, MerR family  29.17 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1058  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2301  MerR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2472  hypothetical protein  34.38 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3474  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0840  transcriptional regulator, MerR family  35.16 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0291  hypothetical protein  35.48 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3218  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.330484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0978  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1328  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000121427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1596  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.265626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0051  transcriptional regulator, MerR family  29.35 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  27.37 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1522  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0919543  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0058  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2331  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1501  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.259398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>