67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1471 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1498  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 
97 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1471  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  100 
 
 
97 aa  199  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0681  stress responsive alpha-beta barrel  51.55 
 
 
97 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0110519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1704  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  40.4 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3353  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.04 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0370758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2425  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.02 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0720467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0045  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  38 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0877  stress responsive A/B barrel domain family protein  33.33 
 
 
98 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3590  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.9 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0287  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.38 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0356838  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4109  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.38 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1340  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  39.58 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000112014  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1061  hypothetical protein  32.94 
 
 
102 aa  60.5  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06521  hypothetical protein  30.3 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1324  hypothetical protein  34.74 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.607655  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02120  hypothetical protein  39 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1344  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.38 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000346703  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3328  Stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.9 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0108  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  35 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142964  normal  0.279268 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2262  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  36.71 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000422116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8969  hypothetical protein  30.53 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0763  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.638539  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0682  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.32 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0757  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.76 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.203414  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3334  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  37.35 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0814828  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4769  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.21 
 
 
135 aa  52  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353943  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0038  hypothetical protein  29.9 
 
 
94 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3797  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.87 
 
 
129 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0625  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  30.39 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0680  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  32.94 
 
 
102 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0525544 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08584  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.209026 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1768  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  36 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.16129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0695  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6606  hypothetical protein  32.29 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2970  hypothetical protein  28.12 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3454  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.42 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0507  hypothetical protein  26.04 
 
 
123 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000108324  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1326  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.76 
 
 
100 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3925  stress responsive alpha-beta  24.71 
 
 
102 aa  47  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1942  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  28.28 
 
 
98 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0917  hypothetical protein  30.69 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.772962  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1221  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  29.33 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000118757  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4485  hypothetical protein  29.89 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0958  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.37 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.476404 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1149  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  29.7 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.565535  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0836  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  34.12 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3290  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  27.37 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000104103  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3356  stress responsive alpha-beta barrel  24.71 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426339  normal  0.411663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1810  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.93 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.479617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1838  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  32.93 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1419  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  27 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0498307  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01204  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16484  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1373  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1923  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5200  hypothetical protein  31.71 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0135  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  30 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.808117  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1543  stress responsive alpha-beta barrel  20.21 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000200194  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_002950  PG0652  hypothetical protein  31.68 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.321969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0033  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  33 
 
 
100 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.412966  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2288  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  23.71 
 
 
109 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.419964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1063  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.69 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.218217  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11290  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
52 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000335398  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4612  stress responsive alpha-beta barrel domain-containing protein  31.76 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3261  hypothetical protein  25 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.332933 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11021  hypothetical protein  27.27 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.672616  normal  0.0742145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4263  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  28.79 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88409  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0915  Stress responsive alpha-beta barrel domain protein  34.69 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.302437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>