61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4212 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 1234 aa  2513    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.71 
 
 		 1235 aa  831    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  38.79 
 
 		 1235 aa  833    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  30.35 
 
 		 1475 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0049  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.04 
 
 		 944 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229879  normal  0.368167 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0622  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  29.01 
 
 		 872 aa  282  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2638  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  35.75 
 
 		 852 aa  267  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.637289 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.2 
 
 		 1343 aa  124  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  23.39 
 
 		 1148 aa  102  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.28 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1094 aa  82.4  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29 
 
 		 644 aa  78.2  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  26.98 
 
 		 773 aa  75.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.74 
 
 		 313 aa  70.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.2 
 
 		 510 aa  70.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  21.11 
 
 		 1237 aa  70.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.71 
 
 		 958 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.23 
 
 		 323 aa  67.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  21.78 
 
 		 2194 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.3 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.91 
 
 		 208 aa  62.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  24.61 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  24.89 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  21.29 
 
 		 1742 aa  62.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  20.9 
 
 		 1345 aa  62  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4437  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  23.31 
 
 		 725 aa  61.6  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.79 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4394  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.88 
 
 		 851 aa  60.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.31 
 
 		 1224 aa  59.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0067  signal transduction protein  24.7 
 
 		 773 aa  59.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.571466  normal  0.0199052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.19 
 
 		 524 aa  58.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  21.36 
 
 		 1349 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1181 aa  55.8  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  21.75 
 
 		 1339 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01700  26S proteasome regulatory subunit Rpn2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08480)  23.94 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0581702 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  26.85 
 
 		 756 aa  55.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 		 251 aa  54.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.16 
 
 		 1438 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3244  signal transduction protein  22.31 
 
 		 799 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0094323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.44 
 
 		 399 aa  52.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  23.36 
 
 		 1133 aa  52.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.53 
 
 		 1412 aa  52.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25 
 
 		 395 aa  52  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  25 
 
 		 395 aa  51.6  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.46 
 
 		 370 aa  51.6  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0650  signal transduction protein  25 
 
 		 801 aa  51.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.190918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  29.24 
 
 		 273 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.64 
 
 		 408 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.96 
 
 		 762 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.96 
 
 		 762 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1916  signal transduction protein  23.62 
 
 		 766 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.394463 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  28.09 
 
 		 541 aa  49.3  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.87 
 
 		 180 aa  49.3  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  23.65 
 
 		 838 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.13 
 
 		 557 aa  48.5  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  19.84 
 
 		 2216 aa  48.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  26.74 
 
 		 299 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1185  hypothetical protein  22.04 
 
 		 647 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.132787  decreased coverage  0.00946214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5325  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25.28 
 
 		 805 aa  46.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  22.92 
 
 		 1141 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18791  hypothetical protein  30.37 
 
 		 269 aa  45.8  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.16399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>