More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3529 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  49.79 
 
 
1198 aa  666    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.36 
 
 
1212 aa  726    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.79 
 
 
1206 aa  674    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3529  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
694 aa  1428    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.20798 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  49.93 
 
 
1203 aa  669    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.27 
 
 
1220 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.39 
 
 
1203 aa  726    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.79 
 
 
1206 aa  679    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.87 
 
 
1258 aa  730    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2246  hydantoinase/oxoprolinase  77.08 
 
 
698 aa  1129    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0794287  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.71 
 
 
1226 aa  741    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.81 
 
 
1250 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.81 
 
 
1239 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  51.65 
 
 
1209 aa  703    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.21 
 
 
1216 aa  724    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.42 
 
 
1229 aa  714    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.5 
 
 
1220 aa  704    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.71 
 
 
1205 aa  680    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.76 
 
 
1210 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49 
 
 
1185 aa  658    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.07 
 
 
1217 aa  657    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.68 
 
 
1213 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.25 
 
 
1222 aa  755    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.94 
 
 
1211 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.92 
 
 
1218 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1233  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  69.87 
 
 
698 aa  1007    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.43 
 
 
1242 aa  731    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  53.08 
 
 
1212 aa  733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.71 
 
 
1206 aa  697    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.86 
 
 
1213 aa  658    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.79 
 
 
1212 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.76 
 
 
1293 aa  684    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.36 
 
 
1212 aa  672    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  51.2 
 
 
1218 aa  688    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1019  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  61.23 
 
 
1331 aa  894    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.65 
 
 
1212 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.36 
 
 
1212 aa  726    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.14 
 
 
1229 aa  669    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.79 
 
 
1229 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  70.16 
 
 
698 aa  1012    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.438874  hitchhiker  0.00293366 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  46.82 
 
 
1245 aa  624  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.85 
 
 
1225 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  40.98 
 
 
1224 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.86 
 
 
1230 aa  488  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00950  cytoplasm protein, putative  37.13 
 
 
1311 aa  483  1e-135  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42276  predicted protein  39.27 
 
 
1263 aa  477  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.33 
 
 
1190 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  37.6 
 
 
1319 aa  466  9.999999999999999e-131  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  39.39 
 
 
1220 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.86 
 
 
1234 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  37.66 
 
 
1274 aa  462  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.574079 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86944  5-oxoprolinase  38.91 
 
 
1322 aa  459  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81320  5-oxoprolinase  37.1 
 
 
1309 aa  458  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05310  5-oxoprolinase, putative  37.47 
 
 
758 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1358  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.29 
 
 
1231 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  37.65 
 
 
1307 aa  439  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  38.06 
 
 
1271 aa  439  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08779  conserved hypothetical protein  37.26 
 
 
1322 aa  435  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02650  cytoplasm protein, putative  35.45 
 
 
763 aa  430  1e-119  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.213568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.12 
 
 
1215 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0219304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0738  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.31 
 
 
1279 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.01 
 
 
1228 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.73 
 
 
1382 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4282  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.03 
 
 
1253 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874898  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3103  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  34.42 
 
 
660 aa  353  7e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.133099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4325  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.56 
 
 
691 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.79538  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0560  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.85 
 
 
657 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.341867  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2410  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.43 
 
 
658 aa  331  3e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4426  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.04 
 
 
692 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1063  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.29 
 
 
663 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.39661  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0321  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.81 
 
 
652 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2039  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  33.13 
 
 
707 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9148  hydantoin utilization protein  31.99 
 
 
687 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4193  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  34.44 
 
 
765 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9128  hydantoin utilization protein  32.54 
 
 
680 aa  294  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2644  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.38 
 
 
651 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4047  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.63 
 
 
676 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0166577  decreased coverage  0.00142198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3568  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.2 
 
 
701 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0985  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.04 
 
 
726 aa  285  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.623858  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1127  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.22 
 
 
641 aa  284  5.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.814296  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6536  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.56 
 
 
678 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2130  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.81 
 
 
687 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1496  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.95 
 
 
706 aa  280  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0678775  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8176  hydantoin utilization protein  30.13 
 
 
681 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2368  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.23 
 
 
680 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.773275  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2860  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.43 
 
 
684 aa  278  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3493  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.48 
 
 
681 aa  277  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.875843  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8320  hydantoin utilization protein  29.69 
 
 
676 aa  276  9e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3601  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.59 
 
 
682 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1577  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.16 
 
 
739 aa  274  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1876  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.61 
 
 
690 aa  273  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6263  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  30.42 
 
 
673 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3091  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.12 
 
 
681 aa  273  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.435048  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1392  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.62 
 
 
657 aa  272  2e-71  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.307503  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6595  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  31.44 
 
 
674 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  28.35 
 
 
683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.471219  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20940  N-methylhydantoinase A/acetone carboxylase, beta subunit  30.81 
 
 
706 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796393  normal  0.0791884 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0132  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  32.54 
 
 
647 aa  270  5e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367806  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5966  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.71 
 
 
694 aa  270  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.858122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3641  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  29.92 
 
 
676 aa  270  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>