48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1338 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1338  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1038    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4158  hypothetical protein  51.88 
 
 		 533 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  0.443107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4118  hypothetical protein  51.68 
 
 		 533 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2720  hypothetical protein  39.49 
 
 		 535 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2634  hypothetical protein  40.11 
 
 		 532 aa  339  7e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.92108 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3563  hypothetical protein  35.8 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2552  hypothetical protein  35.2 
 
 		 528 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.979074  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0281  hypothetical protein  36.61 
 
 		 517 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2173  glycosyl transferase family 39  35.01 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2657  hypothetical protein  35.44 
 
 		 547 aa  260  4e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2442  hypothetical protein  32.2 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3668  hypothetical protein  31.67 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.729511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2984  hypothetical protein  31.19 
 
 		 543 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000954014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4869  hypothetical protein  29.33 
 
 		 569 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0450  hypothetical protein  29.85 
 
 		 592 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.0209625 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0438  hypothetical protein  29.85 
 
 		 592 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0779  hypothetical protein  30.98 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00690091  hitchhiker  0.0000153401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1642  hypothetical protein  23.6 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  27.84 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5106  membrane protein-like protein  28.38 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.390237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3473  hypothetical protein  29.54 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1616  hypothetical protein  23.9 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0156  hypothetical protein  30.36 
 
 		 531 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4315  hypothetical protein  26.04 
 
 		 558 aa  61.2  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1703  putative inner membrane protein  33.58 
 
 		 516 aa  59.7  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0134894  hitchhiker  0.00223393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2647  membrane protein-like  25.66 
 
 		 616 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.071566  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  32 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1756  hypothetical protein  33.58 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1469  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1816  hypothetical protein  33.58 
 
 		 516 aa  57.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1520  putative inner membrane protein  33.58 
 
 		 516 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490211  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1753  hypothetical protein  33.58 
 
 		 516 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0196  hypothetical protein  32.56 
 
 		 563 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0426401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4094  hypothetical protein  28.19 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2451  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4095  membrane protein-like protein  35.96 
 
 		 658 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0777  hypothetical protein  25.43 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0133192  hitchhiker  0.00177112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4896  hypothetical protein  27.37 
 
 		 638 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.303518  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2543  membrane protein-like protein  25.27 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379723  normal  0.0161261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0983  membrane protein-like protein  26.64 
 
 		 534 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5505  membrane protein-like protein  30.93 
 
 		 492 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2507  membrane protein-like protein  29.61 
 
 		 618 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3975  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 483 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2749  membrane protein-like protein  37.33 
 
 		 727 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25171  hypothetical protein  28.11 
 
 		 506 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0233  membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 529 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2650  membrane protein-like  28.31 
 
 		 593 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20544  normal  0.117814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4899  hypothetical protein  29.2 
 
 		 588 aa  43.5  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0731796  normal  0.0477636 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>