More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1227 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  100 
 
 
323 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  84.21 
 
 
323 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  84.21 
 
 
323 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  71.52 
 
 
323 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  69.66 
 
 
323 aa  474  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  69.57 
 
 
323 aa  468  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  68.73 
 
 
323 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  67.08 
 
 
323 aa  441  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  62.54 
 
 
323 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  62.54 
 
 
323 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  60.37 
 
 
323 aa  391  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.3 
 
 
323 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  60.06 
 
 
323 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  61.18 
 
 
323 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  60.06 
 
 
323 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  60.37 
 
 
323 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  59.75 
 
 
323 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  59.44 
 
 
323 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  54.58 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  45.45 
 
 
325 aa  258  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10340  hexaprenyl pyrophosphate synthetase Coq1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06120)  38.52 
 
 
456 aa  236  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  41.14 
 
 
332 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15180  predicted protein  41.19 
 
 
309 aa  230  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.525006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.98 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86778  hexaprenyl pyrophosphate synthetase, mitochondrial precursor (HPS)  42.81 
 
 
465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.337551  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.41 
 
 
320 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.24 
 
 
320 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.24 
 
 
320 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.66 
 
 
320 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01740  trans-hexaprenyltranstransferase, putative  43.87 
 
 
483 aa  208  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.420752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
323 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
323 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
323 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
320 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
320 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  38.92 
 
 
320 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  37.97 
 
 
320 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  37.3 
 
 
322 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.99 
 
 
320 aa  198  9e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 
322 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  34.69 
 
 
322 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.83 
 
 
322 aa  193  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.06 
 
 
323 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  33.13 
 
 
334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.51 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  38.2 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  36.45 
 
 
322 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  35.79 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  35.79 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  35.09 
 
 
325 aa  188  8e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  39.78 
 
 
359 aa  188  9e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  34.69 
 
 
323 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  36.11 
 
 
322 aa  188  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 
322 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  34.59 
 
 
322 aa  187  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.31 
 
 
324 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.82 
 
 
322 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  33.44 
 
 
322 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 
322 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  35.09 
 
 
325 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 
322 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  37.91 
 
 
323 aa  185  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.49 
 
 
337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.51 
 
 
322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  37.63 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  33.33 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.9 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  33.33 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  36.24 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.05 
 
 
343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 
331 aa  182  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  34.89 
 
 
322 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.35 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  35.05 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  36.3 
 
 
323 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 
323 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.77 
 
 
313 aa  181  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.86 
 
 
322 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.13 
 
 
334 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.25 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  38.13 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  38.27 
 
 
323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  35.4 
 
 
323 aa  179  4e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  34.71 
 
 
331 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 
331 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.8 
 
 
318 aa  180  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  35.33 
 
 
323 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.18 
 
 
336 aa  179  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  33.9 
 
 
326 aa  179  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  38.99 
 
 
323 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  33.55 
 
 
322 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 
331 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  34.71 
 
 
331 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.86 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  37.15 
 
 
348 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  36.08 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  36.08 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  36.1 
 
 
331 aa  179  7e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>