More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0172 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0172  putative transposase IS605 family  100 
 
 
431 aa  896    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.55 
 
 
424 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1337  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.31 
 
 
424 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0840  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.31 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.31 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.31 
 
 
424 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.08 
 
 
424 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  57.08 
 
 
424 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  56.84 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  56.84 
 
 
424 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  38.01 
 
 
425 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  34.32 
 
 
362 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 
363 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.54 
 
 
363 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  32.28 
 
 
363 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  32.98 
 
 
373 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
363 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  32.8 
 
 
363 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3850  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
363 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0104951  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3554  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
363 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0417  transposase, IS605 OrfB family  31.48 
 
 
363 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413645  normal  0.0217582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0457  transposase, IS605 OrfB family  31.75 
 
 
363 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.196449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3802  transposase, IS605 OrfB family  31.48 
 
 
363 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  31.89 
 
 
376 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.52 
 
 
361 aa  164  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  30.96 
 
 
411 aa  160  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  31.27 
 
 
380 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  29.29 
 
 
413 aa  156  7e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  30.24 
 
 
380 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1199  transposase, IS605 OrfB family  31.43 
 
 
380 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000673457  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  30.71 
 
 
411 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  30 
 
 
411 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2181  transposase, IS605 OrfB family  31.43 
 
 
380 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.538688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0289  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  29.51 
 
 
380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  29.77 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  30.62 
 
 
383 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  28.9 
 
 
399 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1755  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
371 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  31.25 
 
 
383 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  30.75 
 
 
383 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  29.31 
 
 
383 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  29.31 
 
 
383 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  30.9 
 
 
396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  28.75 
 
 
406 aa  141  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0155  transposase, IS605 OrfB family  29.89 
 
 
466 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565863  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  30.85 
 
 
402 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  31.02 
 
 
338 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  29.22 
 
 
409 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  28.64 
 
 
399 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  31.12 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  31.12 
 
 
348 aa  139  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1517  transposase, IS605 OrfB family  30.77 
 
 
371 aa  139  8.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  30.66 
 
 
399 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  27.95 
 
 
395 aa  139  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.56 
 
 
399 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  29.56 
 
 
399 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  30.62 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4361  transposase, IS605 OrfB family  32.07 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
383 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
383 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  29.2 
 
 
383 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.41 
 
 
431 aa  137  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2201  transposase, IS605 OrfB family  31.22 
 
 
405 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2209  transposase, IS605 OrfB family  31.22 
 
 
405 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000968463 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  30.77 
 
 
348 aa  137  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  29.21 
 
 
411 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2874  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.29 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  29.92 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3222  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.29 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0393444  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  27.85 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  27.85 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3012  transposase, IS605 OrfB family  31.09 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  28.54 
 
 
449 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  29.69 
 
 
405 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  30.81 
 
 
370 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3297  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  33.68 
 
 
307 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  27.32 
 
 
402 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  27.85 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  27.59 
 
 
402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  27.85 
 
 
402 aa  133  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  28.37 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  28.37 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  30.55 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  26.75 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  27.85 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  30.89 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  27.59 
 
 
402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  30.89 
 
 
394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  28.78 
 
 
393 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  29.02 
 
 
393 aa  131  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2853  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.87 
 
 
431 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3243  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  27.87 
 
 
431 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  28.46 
 
 
461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  27.59 
 
 
402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.18 
 
 
399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  29.53 
 
 
373 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.97 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  28.68 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>