More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3297 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009468  Acry_3297  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  38.39 
 
 
381 aa  129  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  38.39 
 
 
381 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2046  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.4 
 
 
424 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2570  transposase, IS605 OrfB family  35.54 
 
 
410 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.373055  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0172  putative transposase IS605 family  34.03 
 
 
431 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1410  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  34.04 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228401  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  34.2 
 
 
402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  41.76 
 
 
424 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  36.49 
 
 
399 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  34.93 
 
 
402 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1366  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.69 
 
 
424 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  35.22 
 
 
413 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  34.93 
 
 
382 aa  112  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  34.93 
 
 
382 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.722641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  34.63 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  34.63 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  33.77 
 
 
402 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  34.63 
 
 
402 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  34.63 
 
 
387 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  32.94 
 
 
348 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  34.2 
 
 
402 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1600  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.33 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  34.66 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0873  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.69 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4643  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.33 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4522  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.33 
 
 
424 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.839734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  34.63 
 
 
402 aa  109  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  32.54 
 
 
348 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  32.54 
 
 
348 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  32.79 
 
 
403 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1337  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.98 
 
 
424 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0840  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.98 
 
 
424 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0586  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  32.98 
 
 
424 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  34.5 
 
 
402 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  34.5 
 
 
402 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  34.2 
 
 
402 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  36.06 
 
 
231 aa  108  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  33.2 
 
 
411 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  33.86 
 
 
411 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  33.74 
 
 
411 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.84 
 
 
431 aa  106  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  34.16 
 
 
411 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  32.75 
 
 
402 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  34.15 
 
 
411 aa  105  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  34.51 
 
 
408 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  31.85 
 
 
422 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  34.51 
 
 
408 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  31.67 
 
 
403 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  33.06 
 
 
400 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  35.82 
 
 
219 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  33.22 
 
 
405 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  35.02 
 
 
397 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  35.02 
 
 
397 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  30.8 
 
 
406 aa  99.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  30.42 
 
 
403 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  32.58 
 
 
435 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  31.67 
 
 
422 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  28.11 
 
 
424 aa  94  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.66 
 
 
361 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0079  IS605 family transposase OrfB  45.69 
 
 
241 aa  92.4  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523128  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1117  IS605 family transposase OrfB  29.44 
 
 
395 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.148504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  30 
 
 
449 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  34.45 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  34.45 
 
 
399 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4127  transposase IS605 OrfB  31.98 
 
 
494 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4167  transposase IS605 OrfB  31.98 
 
 
494 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.220651  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  33.33 
 
 
417 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.23 
 
 
396 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  29.09 
 
 
401 aa  88.6  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1657  transposase  29.59 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  33.87 
 
 
386 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3814  transposase, IS605 OrfB family  30.57 
 
 
363 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000135622  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  29.82 
 
 
380 aa  87  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2076  IS605 family transposase OrfB  32.61 
 
 
380 aa  85.9  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  34.6 
 
 
399 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1391  transposase, IS605 OrfB family  28.63 
 
 
403 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000173221  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2689  transposase, IS605 OrfB family  31.2 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.7 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  32.9 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  30.34 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0388  IS891/IS1136/IS1341 transposase  30.77 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.71 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1464  transposase, IS605 OrfB family  29.96 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0122  transposase  30.71 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0899  transposase, IS605 OrfB family  29.96 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000841843  hitchhiker  0.0000000725079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0319  transposase  29.57 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.484329  normal  0.853888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  37.8 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  33.33 
 
 
399 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3187  transposase, IS605 OrfB family  29.96 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.742933 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  30.04 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2012  transposase, IS605 OrfB family  28.02 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.27721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  29.95 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  29.28 
 
 
370 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3155  transposase, IS605 OrfB family  30.13 
 
 
338 aa  79  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  29.28 
 
 
370 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.56 
 
 
401 aa  79  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  29.47 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  30.58 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0739  transposase, IS605 OrfB family  28.52 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>