More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1159 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.73 
 
 		 556 aa  942    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 556 aa  1124    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.28 
 
 		 552 aa  561  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.6 
 
 		 549 aa  543  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.49 
 
 		 562 aa  531  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.16 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.05 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  54.16 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  54.16 
 
 		 547 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.74 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.98 
 
 		 547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  53.98 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.84 
 
 		 561 aa  508  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  51.69 
 
 		 551 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  51.69 
 
 		 551 aa  488  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  51.6 
 
 		 557 aa  488  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.25 
 
 		 553 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.51 
 
 		 551 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.22 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.22 
 
 		 553 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.87 
 
 		 554 aa  485  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.51 
 
 		 551 aa  485  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 		 554 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.125609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.33 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.22 
 
 		 553 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.87 
 
 		 554 aa  485  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  51.42 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  52.04 
 
 		 553 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  51.87 
 
 		 554 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.33 
 
 		 586 aa  482  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.97 
 
 		 553 aa  478  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.31 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.97 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.97 
 
 		 553 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.82 
 
 		 555 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.87 
 
 		 553 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.42 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.97 
 
 		 553 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.42 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.7 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  51.42 
 
 		 553 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  51.07 
 
 		 553 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 		 562 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  50.1 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  50.1 
 
 		 536 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.25 
 
 		 541 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 		 575 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.74 
 
 		 570 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.9 
 
 		 567 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.64 
 
 		 560 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1940  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.07 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364705  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 		 556 aa  395  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.89 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.54 
 
 		 574 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.241891  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.44 
 
 		 573 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  46.11 
 
 		 533 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.05 
 
 		 555 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  45.9 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  45.56 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.16 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 		 533 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  46.22 
 
 		 533 aa  385  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  45.99 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  45.37 
 
 		 533 aa  386  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  45.19 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  45.19 
 
 		 533 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 		 559 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.56 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  43.54 
 
 		 533 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.27 
 
 		 560 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  43.03 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  45.52 
 
 		 546 aa  381  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.9 
 
 		 568 aa  382  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  45.34 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.34 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  44.49 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.49 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.25 
 
 		 570 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00821394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  45.34 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  45.34 
 
 		 546 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  50.11 
 
 		 470 aa  373  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.02 
 
 		 563 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  67.82 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.99 
 
 		 573 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.273861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.08 
 
 		 651 aa  367  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.86 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.04 
 
 		 557 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.68 
 
 		 555 aa  364  3e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.06 
 
 		 588 aa  363  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.34 
 
 		 601 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 576 aa  362  1e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.47 
 
 		 561 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.28 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  51.12 
 
 		 600 aa  359  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.23 
 
 		 564 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1716  methyl-accepting chemotaxis protein III  50.23 
 
 		 541 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0288519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>