39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0875 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  426  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  97.12 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  73.13 
 
 		 205 aa  307  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  70.42 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  69.95 
 
 		 228 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  71.84 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 217 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 378 aa  208  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  53.12 
 
 		 341 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  53.12 
 
 		 338 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  53.12 
 
 		 338 aa  208  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 341 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 333 aa  207  8e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  53.12 
 
 		 773 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 340 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 212 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 245 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40.51 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  32.71 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 497 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 214 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 194 aa  42  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>