75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_72010  putative glycosyltransferase  100 
 
 
542 aa  1105    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5680  hypothetical protein  55.99 
 
 
523 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6256  hypothetical protein  39.08 
 
 
497 aa  359  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6257  putative glycosyltransferase  50 
 
 
484 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72020  hypothetical protein  48.1 
 
 
433 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5679  hypothetical protein  46.96 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374621  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3861  hypothetical protein  34.62 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00770  glycosyltransferase  32.56 
 
 
916 aa  67  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0057  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
791 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3884  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
359 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.242445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  33.58 
 
 
3301 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 
420 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0855  glycosyl transferase, group 1  34.59 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2764  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
357 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  27.84 
 
 
373 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2364  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
774 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.869085  normal  0.0140446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  33.05 
 
 
1644 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  33.05 
 
 
1644 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1988  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 
374 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.590311  normal  0.0366847 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
860 aa  53.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1720  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.588865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
384 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  26.63 
 
 
859 aa  52.8  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
366 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2484  glycosyl transferase, group 1  30.33 
 
 
856 aa  52  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.672737  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 
435 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
397 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1729  glycosyl transferase, group 1  28.81 
 
 
838 aa  50.1  0.00009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1044 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  23.73 
 
 
370 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
385 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1447  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
338 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000198609 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
616 aa  49.3  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0763  glycosyl transferase group 1  33.61 
 
 
725 aa  49.3  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
383 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  27.56 
 
 
351 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2454  LpsE protein  31.43 
 
 
383 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
373 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 
367 aa  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  32.65 
 
 
787 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  32.48 
 
 
413 aa  48.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2254  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
358 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0765492  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 
364 aa  48.1  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 
378 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
679 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4279  glycosyl transferase, group 1  27.34 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
452 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
369 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
1089 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
390 aa  46.2  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
392 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  23.53 
 
 
1219 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5391  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 
375 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.919124 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0107  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
995 aa  44.7  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4009  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 
1386 aa  44.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2949  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 
332 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 
402 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
624 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  40.82 
 
 
360 aa  44.3  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  41.86 
 
 
394 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
358 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
346 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  24.57 
 
 
382 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
395 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 
393 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6932  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
1233 aa  43.5  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0899413 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2908  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 
401 aa  43.5  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
382 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>