More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05510 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  77.37 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  77.37 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  77.37 
 
 
192 aa  313  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  76.84 
 
 
192 aa  310  6.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  75.79 
 
 
191 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  75.79 
 
 
191 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  75.79 
 
 
191 aa  305  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  74.74 
 
 
191 aa  304  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  75.26 
 
 
191 aa  303  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  75.26 
 
 
192 aa  303  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  75.26 
 
 
191 aa  303  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  74.21 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  74.21 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  74.21 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  78.01 
 
 
192 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  77.49 
 
 
192 aa  298  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  75 
 
 
191 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  71.2 
 
 
192 aa  288  4e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  76.04 
 
 
192 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  61.98 
 
 
191 aa  244  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  61.98 
 
 
191 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  61.98 
 
 
191 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3055  hypothetical protein  61.46 
 
 
191 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0011163  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  61.46 
 
 
191 aa  241  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  61.46 
 
 
191 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  60.94 
 
 
191 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  58.55 
 
 
193 aa  234  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  60.42 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  57.14 
 
 
208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  60.42 
 
 
192 aa  232  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  62.94 
 
 
188 aa  227  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  58.33 
 
 
191 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  57.59 
 
 
191 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0950  hypothetical protein  59.69 
 
 
190 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000269923  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2128  hypothetical protein  66.67 
 
 
191 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000295006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  61.98 
 
 
192 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  61.46 
 
 
192 aa  221  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  63.37 
 
 
177 aa  221  6e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3598  hypothetical protein  56.18 
 
 
199 aa  219  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  61.46 
 
 
192 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  60.94 
 
 
192 aa  218  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  60.94 
 
 
204 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  60.94 
 
 
192 aa  217  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3370  hypothetical protein  59.9 
 
 
191 aa  216  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  55.5 
 
 
189 aa  214  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2890  hypothetical protein  55.75 
 
 
189 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.11559  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  55.14 
 
 
196 aa  209  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  54.5 
 
 
203 aa  206  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  56.32 
 
 
198 aa  203  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  53.12 
 
 
189 aa  201  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  52.08 
 
 
189 aa  191  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  54.91 
 
 
176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  43.92 
 
 
201 aa  184  7e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  49.73 
 
 
179 aa  171  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  44.19 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  41.62 
 
 
213 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  41.62 
 
 
213 aa  136  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  42.02 
 
 
201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  39.02 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  38.41 
 
 
183 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.69 
 
 
182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  38.33 
 
 
196 aa  124  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  38.27 
 
 
183 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  39.01 
 
 
182 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  44.29 
 
 
189 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  38.01 
 
 
182 aa  121  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  38.29 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  39.46 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  37.14 
 
 
187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.33 
 
 
186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.34 
 
 
181 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.52 
 
 
182 aa  114  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  35.63 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.5 
 
 
205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  35.23 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  38.07 
 
 
186 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.51 
 
 
225 aa  112  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  35.75 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.2 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  41.04 
 
 
285 aa  111  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  38.1 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  36.55 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  36.53 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  39.75 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  36.07 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  38.18 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  37.89 
 
 
182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  35.9 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  37.1 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  39.42 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.95 
 
 
195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  33.33 
 
 
182 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.43 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>