More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_26921 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  81.23 
 
 
375 aa  650    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01901  citrate synthase  80.74 
 
 
381 aa  656    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  80.97 
 
 
375 aa  648    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01791  citrate synthase  81.53 
 
 
381 aa  663    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  82.23 
 
 
396 aa  683    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  83.08 
 
 
397 aa  697    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0163  citrate synthase  81.53 
 
 
381 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.292022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  84.04 
 
 
378 aa  672    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01811  citrate synthase  81.53 
 
 
381 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26921  citrate synthase  100 
 
 
396 aa  813    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  73.46 
 
 
386 aa  565  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  68.18 
 
 
378 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  70.51 
 
 
378 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  67.99 
 
 
389 aa  558  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  68 
 
 
383 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  67.38 
 
 
378 aa  549  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  65.6 
 
 
386 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  65.6 
 
 
386 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2141  Citrate (Si)-synthase  56.7 
 
 
389 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.636674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  53.4 
 
 
386 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  53.4 
 
 
386 aa  435  1e-121  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  53.91 
 
 
387 aa  421  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  49.74 
 
 
391 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  46.81 
 
 
375 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  46.7 
 
 
385 aa  350  3e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1621  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 
379 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285346  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.8 
 
 
377 aa  328  9e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  44.47 
 
 
372 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  45.81 
 
 
430 aa  322  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.27 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  43.67 
 
 
372 aa  318  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1726  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 
380 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  43.13 
 
 
382 aa  310  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  309  5e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  309  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  309  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  43.13 
 
 
382 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  43.13 
 
 
382 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  43.13 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.44 
 
 
378 aa  308  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  42.86 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  44.47 
 
 
382 aa  302  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  41.6 
 
 
374 aa  301  1e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  40.37 
 
 
373 aa  300  3e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.12 
 
 
382 aa  298  1e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  39.47 
 
 
370 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  41.51 
 
 
373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  41.51 
 
 
373 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  39.08 
 
 
397 aa  296  4e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  42.05 
 
 
386 aa  295  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  43.46 
 
 
382 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  42.86 
 
 
379 aa  293  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.41 
 
 
409 aa  292  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  40.93 
 
 
412 aa  291  1e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  40.78 
 
 
443 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  39.6 
 
 
427 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1676  citrate synthase  41.97 
 
 
445 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  40.75 
 
 
425 aa  289  6e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  40.55 
 
 
436 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  38.85 
 
 
430 aa  287  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  39.53 
 
 
427 aa  287  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0154  citrate synthase  41.22 
 
 
374 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.649155 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  38.85 
 
 
435 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  41.3 
 
 
455 aa  286  4e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  38.85 
 
 
429 aa  286  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  39.65 
 
 
425 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.67 
 
 
409 aa  286  5e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  39.7 
 
 
439 aa  285  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1149  citrate synthase I  40.05 
 
 
424 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  40.05 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  40.7 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1035  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  40.64 
 
 
375 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  39.23 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  39.1 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  38.68 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  38.35 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  39.59 
 
 
433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  39.95 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  39.95 
 
 
427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  41.43 
 
 
427 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  39.35 
 
 
429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4350  type II citrate synthase  40.82 
 
 
436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  38.56 
 
 
431 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  38.85 
 
 
429 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2068  citrate synthase I  39.75 
 
 
450 aa  282  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal  0.380729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  38.6 
 
 
429 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  38.35 
 
 
434 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  38.5 
 
 
429 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  38.5 
 
 
429 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2105  citrate (Si)-synthase  42.97 
 
 
397 aa  282  9e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.414267  normal  0.0115455 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  39.9 
 
 
431 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  37.98 
 
 
427 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>