More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_21621 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_21621  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 164 aa  330  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0724958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0502  3-dehydroquinate dehydratase  74.42 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0028378  normal  0.126583 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1833  3-dehydroquinate dehydratase  75.19 
 
 		 146 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.120538  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 147 aa  197  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  61.81 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  57.53 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  61.11 
 
 		 145 aa  188  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0383  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 		 166 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03831  3-dehydroquinate dehydratase  68.75 
 
 		 148 aa  183  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  62.22 
 
 		 146 aa  176  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  57.46 
 
 		 153 aa  170  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  61.76 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  56.38 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  63.12 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  57.93 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 146 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0183  3-dehydroquinate dehydratase  57.05 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0858965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  57.75 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 146 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  55.94 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0512  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 146 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.74 
 
 		 150 aa  163  8e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  60.14 
 
 		 155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00170  3-dehydroquinate dehydratase  58.45 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.56 
 
 		 149 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  52.74 
 
 		 150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  60.71 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0530  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 145 aa  162  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0506  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4859  3-dehydroquinate dehydratase, type II  58.87 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4399  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 151 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  58.7 
 
 		 148 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  55.92 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0511  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  57.82 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0948  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 153 aa  160  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00455713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3363  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.36 
 
 		 150 aa  160  6e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.259013 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  56.34 
 
 		 152 aa  160  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0941  3-dehydroquinate dehydratase  55.48 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 149 aa  160  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1476  3-dehydroquinate dehydratase  54.11 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.657033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  56.58 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  57.52 
 
 		 207 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0620  3-dehydroquinate dehydratase  59.44 
 
 		 151 aa  160  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  50.64 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  57.52 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0605  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0599  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06970  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554011  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5566  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  54.17 
 
 		 151 aa  158  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002198  3-dehydroquinate dehydratase II  56.34 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0180031  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  53.1 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64090  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  52.03 
 
 		 150 aa  158  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0768  3-dehydroquinate dehydratase  52.2 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000317323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3593  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 148 aa  158  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  53.42 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0040  3-dehydroquinate dehydratase  60.99 
 
 		 244 aa  157  5e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  59.03 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  58.74 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4605  3-dehydroquinate dehydratase  58.87 
 
 		 150 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.853087  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3940  3-dehydroquinate dehydratase  60.87 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000739911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4088  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 151 aa  157  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 150 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0560  3-dehydroquinate dehydratase  59.57 
 
 		 151 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  53.15 
 
 		 146 aa  157  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3646  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 149 aa  157  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231395 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  59.15 
 
 		 151 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  47.26 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  58.04 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  52.45 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>