More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4311 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 370 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  69.41 
 
 		 369 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  51.9 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  45.92 
 
 		 414 aa  315  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  37.18 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 364 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  33.73 
 
 		 323 aa  191  2e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  30.88 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  29.68 
 
 		 341 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.16 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  28.16 
 
 		 365 aa  150  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  27.9 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  28.16 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.38 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  24.26 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  26.99 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  25.35 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  23.64 
 
 		 368 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  24.71 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  55.74 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4844  transcriptional regulator, LacI family  30.07 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0280353  hitchhiker  0.000467686 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1687  LacI family transcription regulator  25 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.142395 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  24.01 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  23.15 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  27.68 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  23.84 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  25.31 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  25.5 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03674  transcriptional regulator LacI family  25.29 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.96 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  24.29 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  26.09 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.09 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  24.43 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  24.18 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  22.81 
 
 		 338 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  26.55 
 
 		 335 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000770  transcriptional regulator  24.38 
 
 		 342 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  29 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  24.66 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  23.86 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  24.84 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  23.42 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  25.55 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5100  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.88 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.83 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3700  LacI family transcription regulator  21.12 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000696494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  26.03 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3918  LacI family transcription regulator  39.77 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  22.49 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  26.85 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 339 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  25.76 
 
 		 336 aa  57  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5083  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  24.88 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000690772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  24.38 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  25.38 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  22.87 
 
 		 339 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  26.76 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5525  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  22.09 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0911693  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  57.78 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  29.31 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  43.55 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  28.23 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 342 aa  56.2  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00229  putative GalR repressor of contiguous operon, likely to bind a galactoside  42.62 
 
 		 351 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  24.19 
 
 		 350 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5426  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  21.91 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.259242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0911  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  21.67 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.107654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  26.7 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6359  transcriptional regulator, LacI family  44.93 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0051  LacI family transcription regulator  52.17 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000223899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  55.32 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0581  Alanine racemase  28.71 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0953116  normal  0.13709 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5531  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  22.69 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.264023  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  21.11 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002664  LacI-family regulatory protein  24.45 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  24.1 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  21.57 
 
 		 344 aa  54.7  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1870  LacI family transcription regulator  23.96 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0778  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 		 349 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  hitchhiker  0.00400248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  23.55 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1526  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 353 aa  54.3  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.291045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  27.05 
 
 		 350 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2467  LacI family transcription regulator  24.17 
 
 		 351 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000453597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5581  sugar-binding transcriptional regulator, LacI family  25.37 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.44232  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  45.16 
 
 		 342 aa  53.9  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  29.95 
 
 		 327 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  27.66 
 
 		 336 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0177  transcriptional regulator, LacI family  25.45 
 
 		 343 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  25.63 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  24.36 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0547  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 		 325 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000966575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4217  LacI family transcription regulator  25.91 
 
 		 349 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>