More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3819 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3819  integral membrane protein MviN  100 
 
 		 519 aa  1022    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.859074  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  33.72 
 
 		 521 aa  263  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  34.42 
 
 		 528 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  33.53 
 
 		 526 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  32.88 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  33.41 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  35.25 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  34.41 
 
 		 521 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  34.75 
 
 		 517 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2444  integral membrane protein MviN  36.38 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.410377  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  36.5 
 
 		 541 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  34.08 
 
 		 523 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  34.32 
 
 		 523 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  31.15 
 
 		 522 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  37.59 
 
 		 534 aa  219  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  35.54 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0493  integral membrane protein MviN  34.57 
 
 		 498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  33.21 
 
 		 518 aa  216  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3339  integral membrane protein MviN  35.16 
 
 		 522 aa  213  7e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  35.76 
 
 		 515 aa  213  9e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  36.63 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  32.18 
 
 		 522 aa  212  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  36.32 
 
 		 535 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  32.48 
 
 		 521 aa  211  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  36 
 
 		 511 aa  210  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2529  integral membrane protein MviN  34.61 
 
 		 537 aa  209  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2836  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 		 539 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.36 
 
 		 529 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  33.02 
 
 		 573 aa  203  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  33.11 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  35.44 
 
 		 530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  29.45 
 
 		 523 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2568  peptidase M24A  30.89 
 
 		 533 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0415  virulence factor  32.52 
 
 		 518 aa  200  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000799627  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  36.54 
 
 		 524 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0298  integral membrane protein MviN  31.88 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136204  normal  0.705854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  32.75 
 
 		 511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  36.03 
 
 		 495 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  30.8 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0578  virulence factor MviN homolog  31.25 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000238357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0212  MviN protein  30.44 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000338413  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1180  integral membrane protein MviN  32.32 
 
 		 531 aa  198  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.70364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  30.25 
 
 		 534 aa  198  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  32.91 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  32.5 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  32.78 
 
 		 517 aa  196  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  31.91 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  31.49 
 
 		 529 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  30.92 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3569  integral membrane protein MviN  31.58 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0510  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 516 aa  194  4e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.721239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  31.63 
 
 		 545 aa  193  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  30.6 
 
 		 505 aa  193  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  32.42 
 
 		 511 aa  193  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  32.57 
 
 		 528 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  32.34 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  36.67 
 
 		 536 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1289  integral membrane protein MviN  30.82 
 
 		 519 aa  192  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000157421  normal  0.416972 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1776  integral membrane protein MviN  32.52 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  36.41 
 
 		 536 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00978  hypothetical protein  30.96 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3180  integral membrane protein MviN  31.04 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0425  integral membrane protein MviN  33.57 
 
 		 532 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 530 aa  191  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  31.25 
 
 		 511 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  30.55 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 542 aa  190  7e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  32.14 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  32.14 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  32.14 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  31.76 
 
 		 524 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  31.27 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  33.02 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004421  hypothetical protein  30.72 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000372973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  32.84 
 
 		 517 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  30.2 
 
 		 512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1436  integral membrane protein MviN  33.4 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2725  integral membrane protein MviN  29.54 
 
 		 519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000329749  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  32.25 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  30.58 
 
 		 545 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  30 
 
 		 512 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0032  integral membrane protein MviN  33.33 
 
 		 535 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  hitchhiker  0.0000209824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  29.16 
 
 		 512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  32.51 
 
 		 532 aa  183  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  32.64 
 
 		 521 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  31.72 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  32.23 
 
 		 517 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>