More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3203 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3203  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 375 aa  768    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0127391  normal  0.898845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4310  LacI family transcription regulator  52.51 
 
 		 369 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4311  LacI family transcription regulator  51.9 
 
 		 370 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3374  LacI family transcription regulator  44.07 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4284  LacI family transcription regulator  36.13 
 
 		 351 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4277  LacI family transcription regulator  35.85 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0521  LacI family transcription regulator  32.96 
 
 		 364 aa  182  8.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0520  LacI family transcription regulator  31.83 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3108  transcriptional regulators-like protein  34.43 
 
 		 323 aa  179  9e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0737433 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1384  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.934353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1018  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4267  LacI family transcription regulator  29.07 
 
 		 330 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1990  LacI family transcription regulator  29.83 
 
 		 341 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0741894 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4286  LacI family transcription regulator  32.31 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4343  LacI family transcription regulator  28.77 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.905515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1357  LacI family transcription regulator  26.4 
 
 		 357 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0927  LacI family transcription regulator  26.72 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  28.34 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4539  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 350 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  24.25 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  25.47 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  30.15 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2170  LacI family transcription regulator  40.58 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.626121  normal  0.28501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  24.05 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  25.77 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  24.5 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4158  alanine racemase  48.28 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  27.23 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  45.45 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3799  transcriptional regulator, LacI family  28.1 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  24.57 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  25.17 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2847  LacI family transcription regulator  28.36 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000654986  normal  0.737753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  27.09 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3970  LacI family transcription regulator  28.81 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.149546 
 
 
-
 
NC_003296  RS02195  transcription regulator transcription regulator protein  26.47 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.479594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4333  transcriptional regulator, LacI family  27.23 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  23.76 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2290  transcriptional regulator, LacI family  26.4 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.950174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  23.68 
 
 		 342 aa  57  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  28.22 
 
 		 353 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.86 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2480  transcriptional regulator, LacI family  27.99 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.725797  normal  0.877473 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2486  regulatory protein, LacI  26.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000764665  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2586  regulatory protein LacI  26.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00126886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  26.96 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2695  regulatory protein LacI  26.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0362196  normal  0.839306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  24.39 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2532  regulatory protein LacI  26.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000782383  normal  0.6775 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  46.88 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2574  regulatory protein LacI  26.26 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00791784  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1686  LacI family transcription regulator  22.31 
 
 		 356 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.155219 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0752  LacI family transcription regulator  45 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3595  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4772  LacI family transcription regulator  27.38 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.819593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  25.97 
 
 		 348 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2898  transcriptional regulator, LacI family  28.08 
 
 		 350 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  25.96 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5511  LacI family transcription regulator  27.22 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732614  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1808  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  23.15 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.379781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2894  transcriptional regulator, LacI family  26.6 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  29.35 
 
 		 353 aa  55.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0256  regulatory protein, LacI  24.17 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2332  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0262  regulatory protein LacI  24.17 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  24.18 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1849  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0321954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  27.46 
 
 		 336 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2238  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4596  transcriptional regulator, LacI family  26.37 
 
 		 340 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0502076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  46.03 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1623  transcriptional regulator, LacI family  21.98 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  26.89 
 
 		 357 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4611  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2083  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2582  alanine racemase  27.32 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528226 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3313  transcriptional regulator, LacI family  51.72 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0187548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00229  putative GalR repressor of contiguous operon, likely to bind a galactoside  40.62 
 
 		 351 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  25.53 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2760  transcriptional regulator, LacI family  55.1 
 
 		 333 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  22.97 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2351  LacI family transcription regulator  26.26 
 
 		 331 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0288432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1978  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.43 
 
 		 339 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.351536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0116  transcriptional regulator, LacI family  26.73 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  25.67 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  28.64 
 
 		 332 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  26.06 
 
 		 326 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0385  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.32 
 
 		 354 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  24.32 
 
 		 336 aa  53.9  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4691  transcriptional regulator, LacI family  26.29 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  28.18 
 
 		 347 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2559  alanine racemase  42.37 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1372  galactose operon repressor  24.5 
 
 		 331 aa  53.1  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  26.39 
 
 		 346 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3955  transcriptional regulator, LacI family  24.79 
 
 		 364 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337972  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  46.67 
 
 		 342 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>