25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2750 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  100 
 
 		 489 aa  967    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  28.45 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  23.38 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.34 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  23.41 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  28.93 
 
 		 607 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.48 
 
 		 408 aa  53.5  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.48 
 
 		 408 aa  53.5  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  25.72 
 
 		 429 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 433 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 489 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  25.36 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 832 aa  48.9  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  27.41 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  22.77 
 
 		 470 aa  47.4  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 509 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  24.69 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 686 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  24.91 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  31.11 
 
 		 686 aa  45.8  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.09 
 
 		 754 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  24.77 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>