More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2575 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2575  translation elongation factor P  100 
 
 
185 aa  377  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156985  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3606  translation elongation factor P (EF-P)  46.7 
 
 
186 aa  177  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1054  elongation factor P  42.86 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.636587  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1849  elongation factor P  44.32 
 
 
185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.583476  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2891  elongation factor P  47.85 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.780726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0323  elongation factor P  41.08 
 
 
233 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0872973  normal  0.0117476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0874  Elongation factor P  41.34 
 
 
188 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3411  elongation factor P  41.08 
 
 
187 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186085  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1660  translation elongation factor P  43.48 
 
 
186 aa  159  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1842  elongation factor P  43.78 
 
 
185 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145946  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1705  translation elongation factor P  40.76 
 
 
187 aa  158  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215577  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0292  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  157  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.443832  normal  0.0255427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0200  elongation factor P  38.92 
 
 
188 aa  157  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1518  elongation factor P  40 
 
 
187 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0233  elongation factor P  43.78 
 
 
185 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2675  elongation factor P  40 
 
 
188 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0684  elongation factor P  41.21 
 
 
189 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4050  elongation factor P  43.78 
 
 
185 aa  155  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2339  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2943  translation elongation factor P  41.62 
 
 
185 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000799114  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0361  elongation factor P  39.46 
 
 
188 aa  154  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4270  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4101  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00461512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3939  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3950  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4421  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4327  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4307  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4217  elongation factor P  43.24 
 
 
185 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.691003 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1958  elongation factor P  38.38 
 
 
212 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000139514  normal  0.25468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0927  elongation factor P  42.7 
 
 
185 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1313  elongation factor P  40.76 
 
 
185 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0237  elongation factor P  39.78 
 
 
188 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3145  translation elongation factor P  41.62 
 
 
185 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027119 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0664  translation elongation factor P  41.3 
 
 
185 aa  151  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1305  elongation factor P  40 
 
 
187 aa  150  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.656375  normal  0.0587891 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0920  translation elongation factor P  42.22 
 
 
187 aa  150  8e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0356  elongation factor P  41.11 
 
 
194 aa  150  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.142965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2007  elongation factor P  40.22 
 
 
187 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000960288 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1838  translation elongation factor P  41.3 
 
 
187 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.464834  normal  0.192185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2270  elongation factor P  40.22 
 
 
187 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0077  elongation factor P  37.57 
 
 
190 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164055 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1329  translation elongation factor P  40.22 
 
 
187 aa  149  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.708183  normal  0.80129 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0655  elongation factor P  39.34 
 
 
189 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1379  elongation factor P  39.34 
 
 
189 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0082  elongation factor P  41.21 
 
 
188 aa  149  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0576  elongation factor P  39.34 
 
 
189 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.925832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00251  elongation factor P  40.76 
 
 
186 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0564  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1082  translation elongation factor P (EF-P)  39.34 
 
 
189 aa  148  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.160371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0547  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2417  elongation factor P  38.04 
 
 
187 aa  147  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1093  elongation factor P  39.46 
 
 
187 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1390  translation elongation factor P  40.32 
 
 
186 aa  147  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.842759  normal  0.106183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1458  translation elongation factor P (EF-P)  37.5 
 
 
185 aa  147  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0677588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0693  translation elongation factor P  41.01 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1187  elongation factor P  39.44 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5084  elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2161  elongation factor P  39.13 
 
 
187 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1034  translation elongation factor P  39.67 
 
 
185 aa  145  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3009  elongation factor P  39.01 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.144718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3148  translation elongation factor P  40 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4276  translation elongation factor P  36.96 
 
 
186 aa  144  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0449484  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1093  elongation factor P  41.08 
 
 
185 aa  144  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17910  translation elongation factor P (EF-P)  39.67 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.272241  normal  0.645314 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00251  elongation factor P  39.13 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00261  elongation factor P  40.22 
 
 
186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.382229  normal  0.051277 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1587  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00812845  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1620  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  144  8.000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2055  elongation factor P  38.59 
 
 
187 aa  144  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1247  elongation factor P  37.7 
 
 
189 aa  144  9e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06150  translation elongation factor P  36.76 
 
 
186 aa  143  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0622  translation elongation factor P  39.44 
 
 
187 aa  143  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.449055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2853  elongation factor P  39.78 
 
 
186 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0026  elongation factor P  39.13 
 
 
186 aa  143  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2565  elongation factor P  40.22 
 
 
185 aa  144  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.870653  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1005  translation elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  143  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0968  translation elongation factor P  40 
 
 
187 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0682  translation elongation factor P  39.33 
 
 
190 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0033  elongation factor P  39.67 
 
 
187 aa  143  2e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0132  elongation factor P  37.16 
 
 
188 aa  143  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2693  elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0879  translation elongation factor P  39.78 
 
 
216 aa  143  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.351022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0682  translation elongation factor P  39.33 
 
 
190 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0648  translation elongation factor P (EF-P)  39.33 
 
 
190 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.581307  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1531  translation elongation factor P (EF-P)  38.04 
 
 
186 aa  142  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00313257  normal  0.194022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15510  elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285367  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00251  elongation factor P  38.59 
 
 
186 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.202091  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00251  elongation factor P  39.67 
 
 
187 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1037  elongation factor P  40 
 
 
185 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.429569  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1353  elongation factor P  39.67 
 
 
187 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14700  translation elongation factor P (EF-P)  38.38 
 
 
185 aa  142  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.948878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0748  elongation factor P  38.38 
 
 
189 aa  141  5e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.305929  hitchhiker  0.000261541 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1713  translation elongation factor P  40.22 
 
 
189 aa  141  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1953  elongation factor P  38.04 
 
 
185 aa  141  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000145103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0376  elongation factor P  38.12 
 
 
188 aa  140  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1538  elongation factor P  37.84 
 
 
185 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.112402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2393  translation elongation factor P  38.59 
 
 
187 aa  140  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1301  elongation factor P  39.13 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.268628 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0511  elongation factor P  37.7 
 
 
187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>