183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2299 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2299  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 309 aa  645    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.002919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1575  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.47256 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5485  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.269586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2193  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 336 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00124948 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1576  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0327  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 281 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2803  radical SAM domain-containing protein  35.65 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.246146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2293  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 385 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.972622  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0286  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 		 269 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  40.22 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0799  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 374 aa  122  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.737474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2509  hypothetical protein  32.32 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.690045 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1409  radical SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.47505  normal  0.209816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0870  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0400323  normal  0.723126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1693  Radical SAM domain protein  32.46 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637102  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2545  radical SAM family protein  32.28 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3135  radical SAM family protein  32.25 
 
 		 365 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.787669  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2814  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 343 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2719  Radical SAM domain protein  34.62 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0556  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.162631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05793  radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4466  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2078  hypothetical protein  38.07 
 
 		 182 aa  115  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.583376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1617  radical SAM family protein  31.54 
 
 		 415 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0015  Radical SAM domain protein  31.84 
 
 		 363 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.811476  hitchhiker  0.00130653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0556  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1060  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1782  radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.425379  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0928  hypothetical protein  31.71 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2176  radical SAM domain-containing protein  35.32 
 
 		 372 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1991  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 294 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0959  radical SAM domain-containing protein  32.13 
 
 		 258 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00609549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1658  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0587  radical SAM family protein  30.29 
 
 		 392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1066  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2403  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1252  radical SAM domain-containing protein  31.2 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1025  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0946  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0685  radical SAM domain-containing protein  31.86 
 
 		 294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0316247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1003  hypothetical protein  29.43 
 
 		 381 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2972  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2923  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2549  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 385 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0923  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 385 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2862  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22952  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0224  radical SAM domain-containing protein  29.81 
 
 		 385 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4180  radical SAM family protein  29.88 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0182  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2980  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 381 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0187919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0942  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0406  radical SAM domain-containing protein  30.96 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1480  hypothetical protein  29.74 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000411506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1773  radical SAM family protein  30.31 
 
 		 378 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2237  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 392 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0196  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03695  radical SAM domain protein  28.27 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1926  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0235565 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0798  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.442309 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3325  radical SAM family protein  31.4 
 
 		 368 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000113455 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2123  radical SAM domain-containing protein  34.9 
 
 		 362 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1500  radical SAM family protein  31.71 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1769  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0083  radical SAM family protein  34.33 
 
 		 352 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1266  radical SAM family protein  34.38 
 
 		 360 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.249898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0937  hypothetical protein  33.66 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388526  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0268  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698085  normal  0.0396119 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0452  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 		 385 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0767  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 386 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.338567 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1829  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1080  radical SAM family protein  33.17 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.981176  normal  0.301506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0547  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1419  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2600  DNA repair photolyase  30.16 
 
 		 386 aa  99.4  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.64054  normal  0.361396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3951  radical SAM domain-containing protein  33.5 
 
 		 360 aa  99  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.934636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0707  radical SAM domain-containing protein  32.81 
 
 		 421 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0399019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1206  radical SAM family protein  32.16 
 
 		 393 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1469  radical SAM family protein  34.57 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.637197 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0708  radical SAM domain-containing protein  32.98 
 
 		 362 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0517  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.619466 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2459  hypothetical protein  27.31 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0853217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0117  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.190485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0561  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2341  hypothetical protein  32.66 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3222  radical SAM family protein  30 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1225  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.931656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2633  radical SAM domain-containing protein  35.47 
 
 		 343 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1433  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 395 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.908326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0739  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 245 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.93142  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3675  radical SAM domain-containing protein  32.22 
 
 		 371 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.852388 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0334  Radical SAM domain protein  30.38 
 
 		 357 aa  95.9  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1946  radical SAM domain-containing protein  31.74 
 
 		 437 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0289  radical SAM family protein  30.17 
 
 		 352 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4362  radical SAM family protein  32.16 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16102  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0398  radical SAM domain-containing protein  31.63 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0113  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0099  radical SAM domain protein  29.58 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0290614 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1137  Radical SAM domain protein  32.22 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0922  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 387 aa  94  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.56559  normal  0.49234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0114  radical SAM domain-containing protein  29.58 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>