113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1153 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1153  paraquat-inducible protein A  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136133  normal  0.393149 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0482  paraquat-inducible protein A  35.09 
 
 		 181 aa  62  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1014  paraquat-inducible protein A  29.33 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36030  paraquat-inducible protein A  27.81 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000103971 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0580  paraquat-inducible protein A  29.75 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0166734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6817  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2673  paraquat-inducible protein A  30.92 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.44394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0644  paraquat-inducible protein A  27.33 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00578555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1570  paraquat-inducible protein A  30.16 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1994  paraquat-inducible protein A  29.52 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.338034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4564  paraquat-inducible protein A  29.8 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0639  paraquat-inducible protein A  29.14 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.224706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4781  paraquat-inducible protein A  27.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0138  paraquat-inducible protein A  32.26 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0293  paraquat-inducible protein A  32.03 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1155  paraquat-inducible protein A  32.03 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3339  paraquat-inducible protein A  32.03 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3373  paraquat-inducible protein A  32.03 
 
 		 220 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3381  putative paraquat-inducible protein  32.03 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0258  paraquat-inducible protein A  27.39 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3333  hypothetical protein  28.48 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.375682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2678  paraquat-inducible protein A  26.97 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62030  paraquat-inducible protein A-like protein  26.67 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0197125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2693  paraquat-inducible protein A  30.34 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5397  paraquat-inducible protein A  26.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563787  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5801  PqiA family integral membrane protein  32.81 
 
 		 462 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0413945  hitchhiker  0.00262359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1446  Paraquat-inducible protein A  26.71 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257026  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0329  Paraquat-inducible protein A  31.58 
 
 		 210 aa  52  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2534  paraquat-inducible protein A  26.8 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3044  paraquat-inducible protein A  25.16 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.123343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1269  hypothetical protein  30.71 
 
 		 220 aa  51.6  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1651  integral membrane protein, PqiA family  27.52 
 
 		 422 aa  51.2  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2007  hypothetical protein  27.1 
 
 		 444 aa  51.2  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0228  paraquat-inducible protein A  30.47 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3907  paraquat-inducible protein A  32.61 
 
 		 188 aa  50.8  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0712  paraquat-inducible protein A  30.47 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0679  paraquat-inducible protein A  30.47 
 
 		 211 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1705  PqiA family integral membrane protein  28.21 
 
 		 402 aa  50.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2114  PqiA family integral membrane protein  25.44 
 
 		 426 aa  50.8  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.387585  normal  0.0225112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2933  PqiA family integral membrane protein  28.85 
 
 		 423 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2073  PqiA family integral membrane protein  26.62 
 
 		 406 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.225141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02655  integral membrane protein, PqiA family  24.65 
 
 		 380 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.399105  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0518  Paraquat-inducible protein A  28.48 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1864  PqiA family integral membrane protein  25.44 
 
 		 426 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0424283 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0603  paraquat-inducible protein A  29.13 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0627  paraquat-inducible protein A  29.13 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1104  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.163733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1172  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.718604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1126  Pqi5  27.27 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.865331  normal  0.906807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1021  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00323586  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1138  paraquat-inducible protein A  27.27 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.946739  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00954  paraquat-inducible membrane protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000174021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2693  integral membrane protein, PqiA family  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.098958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3076  PqiA family integral membrane protein  27.87 
 
 		 405 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00961  hypothetical protein  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3327  paraquat-inducible protein A  29.8 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.406152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1919  PqiA family integral membrane protein  24.84 
 
 		 427 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1108  hypothetical protein  26.25 
 
 		 419 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000845315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44080  PqiA family protein  27.98 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179105  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1059  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000508779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1065  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2646  PqiA family integral membrane protein  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00999711  hitchhiker  0.00049713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2169  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000394614  normal  0.228835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2367  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.658309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1114  paraquat-inducible protein A  25.5 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0100863  normal  0.917256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3375  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 212 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0541727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0039  putative paraquat-inducible protein  29.87 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.355976  normal  0.169833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2721  hypothetical protein  26.88 
 
 		 413 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5823  paraquat-inducible protein A  31.53 
 
 		 401 aa  47.8  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166267  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3800  paraquat-inducible protein A  31.25 
 
 		 209 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3999  putative paraquat-inducible protein  30.7 
 
 		 216 aa  47.4  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.5072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0708  Paraquat-inducible protein A  29.82 
 
 		 220 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.773576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1324  integral membrane protein, PqiA family  24.52 
 
 		 489 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153858  normal  0.426119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3076  Paraquat-inducible protein A  29.03 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3860  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3953  paraquat-inducible protein A  29.41 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4068  hypothetical protein  30.39 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42460  Paraquat-inducible protein A  27.15 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5277  PqiA family integral membrane protein  45.45 
 
 		 460 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0531  Paraquat-inducible protein A  27.81 
 
 		 245 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0602  hypothetical protein  30.91 
 
 		 247 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0796336  normal  0.593328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1462  PqiA family integral membrane protein  24.16 
 
 		 417 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.103115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2083  paraquat-inducible protein A  28.57 
 
 		 420 aa  45.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0097  paraquat-inducible protein A  30.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4303  paraquat-inducible protein A  30.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4443  paraquat-inducible protein A  30.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.951791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4248  Paraquat-inducible protein A  30.08 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1783  paraquat-inducible protein A  32.26 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.266349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3492  paraquat-inducible protein A  31.4 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3870  paraquat-inducible protein A  30.89 
 
 		 207 aa  44.7  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1682  integral membrane protein, PqiA family  25.89 
 
 		 422 aa  44.3  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3510  hypothetical protein  24.68 
 
 		 464 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.21998  normal  0.777652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4089  paraquat-inducible protein A  24.18 
 
 		 423 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.645916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2666  PqiA family integral membrane protein  34.44 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00001448  normal  0.0124404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1780  PqiA family integral membrane protein  34.44 
 
 		 450 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0402  paraquat-inducible protein A  26.32 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0283  hypothetical protein  29.35 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1571  paraquat-inducible protein A  25.66 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1669  PqiA family integral membrane protein  34.44 
 
 		 415 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000392356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2550  paraquat-inducible protein A  26.36 
 
 		 428 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.731619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>