More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4403 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4403  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 318 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.210844  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1594  dihydrodipicolinate synthetase  63.49 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1453  dihydrodipicolinate synthetase  63.09 
 
 		 317 aa  421  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.535565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3897  dihydrodipicolinate synthetase  27.16 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2161  dihydrodipicolinate synthase  25.83 
 
 		 291 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1872  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  25.93 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  27.42 
 
 		 297 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.43 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0178  N-acetylneuraminate lyase  32.56 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0175  N-acetylneuraminate lyase  32.56 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  23.76 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  26.86 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  28.43 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3829  dihydrodipicolinate synthase  25.82 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.277082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  25.91 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  23.1 
 
 		 289 aa  93.2  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  26.97 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  25.88 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.12 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  28.48 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2168  dihydrodipicolinate synthase  26.25 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1674  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.954641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1696  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  26.73 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0532  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1724  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1740  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  23.1 
 
 		 289 aa  90.5  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0558  dihydrodipicolinate synthetase  24.92 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.6555  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4352  dihydrodipicolinate synthetase  26.71 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  24.09 
 
 		 293 aa  90.1  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  27.2 
 
 		 302 aa  89.4  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  24.75 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  26.43 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  25.16 
 
 		 296 aa  89  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  27.24 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  24.92 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0305  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  24.16 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0298  N-acetylneuraminate lyase  28.57 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  27.67 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7859  dihydrodipicolinate synthase  28.14 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.31907  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  25.96 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  24.09 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  25.74 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  25.76 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  26.4 
 
 		 301 aa  87  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  25 
 
 		 305 aa  87  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  28.83 
 
 		 302 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  25.5 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0695  N-acetylneuraminate lyase  29.03 
 
 		 292 aa  86.7  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  22.44 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  26.16 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  23.83 
 
 		 291 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  25.56 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  30.63 
 
 		 294 aa  85.9  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  25.41 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  24.59 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4841  dihydrodipicolinate synthase  27 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00571792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  26.53 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  23.23 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  25.41 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  24.58 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  27.09 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5264  dihydrodipicolinate synthetase  25.58 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  26.67 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  24.34 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1503  dihydrodipicolinate synthase  25.17 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00000230491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  26.32 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  27.36 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  26.1 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>