More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4065 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1632  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  91.77 
 
 
486 aa  921    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4065  ABC transporter related  100 
 
 
505 aa  1028    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0517348  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1576  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  91.26 
 
 
492 aa  927    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.369158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1397  ABC transporter related  79.47 
 
 
492 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0472986  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2284  ABC transporter related  52.45 
 
 
494 aa  514  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0455  ABC-type sugar transport system, ATPase component  54.49 
 
 
493 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0360  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.49 
 
 
493 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1814  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 
493 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.325907  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0812  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  53.74 
 
 
505 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1103  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 
493 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2076  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  54.08 
 
 
493 aa  499  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0912  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  53.29 
 
 
502 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0966  ABC transporter related  53.29 
 
 
502 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22100  ABC transporter protein  53.85 
 
 
497 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3881  sugar transport ATP-binding protein  53.68 
 
 
502 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0578526 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2571  ABC transporter  52.12 
 
 
495 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2046  ABC transporter related  53.05 
 
 
489 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0249  ABC transporter component  51.23 
 
 
493 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0268324  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4583  ABC transporter related  50.2 
 
 
500 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  48.16 
 
 
494 aa  455  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  47.58 
 
 
525 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  47.14 
 
 
525 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  46.25 
 
 
523 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  47.25 
 
 
513 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.45 
 
 
515 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.82 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  46.54 
 
 
512 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.05 
 
 
513 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  45.89 
 
 
524 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  46.53 
 
 
521 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
501 aa  432  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  45.92 
 
 
501 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  45.86 
 
 
511 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.14 
 
 
527 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  45.93 
 
 
524 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  45.49 
 
 
524 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  45.49 
 
 
524 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.54 
 
 
503 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  45.69 
 
 
524 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  45.49 
 
 
524 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  45.71 
 
 
501 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  46.26 
 
 
518 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  45.82 
 
 
516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  45.82 
 
 
516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  430  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  45.82 
 
 
516 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.75 
 
 
513 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  45.71 
 
 
501 aa  430  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  46.01 
 
 
501 aa  431  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  45.82 
 
 
516 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
496 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  45.71 
 
 
501 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  45.51 
 
 
501 aa  428  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.73 
 
 
516 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.23 
 
 
501 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4115  D-ribose transporter ATP binding protein  44.79 
 
 
501 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.684938  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.56 
 
 
524 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1371  D-ribose transporter ATP binding protein  45.15 
 
 
504 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  43.97 
 
 
516 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  45.15 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  45.53 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.9 
 
 
501 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  44.95 
 
 
501 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.72 
 
 
513 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  44.54 
 
 
501 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.83 
 
 
501 aa  413  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0010  D-ribose transporter ATP binding protein  45.57 
 
 
500 aa  414  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  44.21 
 
 
503 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4010  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
500 aa  411  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.56 
 
 
511 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  44.02 
 
 
494 aa  409  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  45.36 
 
 
511 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  42.24 
 
 
496 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0944  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 
502 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  43.12 
 
 
499 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  43.12 
 
 
499 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  42.94 
 
 
511 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  44.31 
 
 
501 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  43.56 
 
 
511 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  46.23 
 
 
514 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1703  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
504 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  44.11 
 
 
513 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  43.27 
 
 
497 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  42.74 
 
 
511 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0515  D-ribose transporter ATP binding protein  43.71 
 
 
501 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  43.6 
 
 
513 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4768  ABC transporter related  46.23 
 
 
503 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957059  normal  0.347139 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.2 
 
 
504 aa  401  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3018  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0173855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1564  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  42.74 
 
 
502 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2466  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  43.64 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2565  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 
506 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  43.99 
 
 
514 aa  401  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  42.65 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  42.62 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  43.64 
 
 
512 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>