More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3794 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  1008    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  36.5 
 
 		 506 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  34.57 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  28 
 
 		 333 aa  136  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  30.24 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  26.69 
 
 		 333 aa  126  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  25.31 
 
 		 328 aa  125  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  28.48 
 
 		 334 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  27.69 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  26.32 
 
 		 333 aa  123  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  27.58 
 
 		 333 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  27.58 
 
 		 333 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  26.52 
 
 		 327 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  30.4 
 
 		 323 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  26.36 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  26.06 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  26.06 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  28.76 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  28.76 
 
 		 317 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  28.32 
 
 		 317 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 301 aa  91.3  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 301 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  24.02 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  25.23 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 376 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 325 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  31.19 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  47.06 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1567  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 339 aa  76.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.315366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  46.74 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 319 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  48.72 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  48.72 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.69 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  48.1 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4514  LysR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 317 aa  67  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.303471 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 310 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  52.31 
 
 		 307 aa  66.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2137  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 345 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2049  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349859  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1896  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.784127  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2016  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0352471  normal  0.432808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  50 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4833  LysR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.939705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2884  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 100 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.09254 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  43.96 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32105  predicted protein  30.81 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00110753  normal  0.0624968 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  43.18 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.493316 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.93 
 
 		 337 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2566  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.258104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1821  anthranilate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 338 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3100  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3885  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2768  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 336 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.34 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  53.85 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1140  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5134  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0998193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4671  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.989692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>