More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2030 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2030  elongation factor Ts  100 
 
 
310 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1161  elongation factor Ts  92.13 
 
 
305 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.352257  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1118  elongation factor Ts  92.13 
 
 
305 aa  543  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.681588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1382  elongation factor Ts  73.74 
 
 
307 aa  448  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2525  elongation factor Ts  71.48 
 
 
308 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0584  elongation factor Ts  74.92 
 
 
307 aa  444  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.227112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1584  elongation factor Ts  73.77 
 
 
308 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1777  elongation factor Ts  73.44 
 
 
308 aa  434  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1132  elongation factor Ts  70.68 
 
 
307 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3267  elongation factor Ts  58.09 
 
 
308 aa  352  7e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.285007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1858  elongation factor Ts  57.14 
 
 
307 aa  347  1e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0307388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4516  elongation factor Ts  57.91 
 
 
300 aa  342  5.999999999999999e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1695  elongation factor Ts  56.12 
 
 
307 aa  342  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2856  elongation factor Ts  56.11 
 
 
308 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3195  translation elongation factor Ts  61.31 
 
 
308 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2804  elongation factor Ts  57.57 
 
 
312 aa  336  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00290624  normal  0.651872 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1211  elongation factor Ts  59.48 
 
 
291 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3725  elongation factor Ts  57 
 
 
296 aa  334  9e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.208993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2827  elongation factor Ts  55.81 
 
 
308 aa  333  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.161224  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2305  elongation factor Ts  58.69 
 
 
291 aa  332  4e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427266  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1381  elongation factor Ts  56.21 
 
 
312 aa  331  9e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.281717  normal  0.0336463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1587  elongation factor Ts  58.03 
 
 
309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612941  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3348  elongation factor Ts  57.28 
 
 
301 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.955126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2437  elongation factor Ts  54.79 
 
 
308 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223909  normal  0.179071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4828  elongation factor Ts  58.31 
 
 
307 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0383674  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1697  elongation factor Ts  58.63 
 
 
307 aa  315  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4438  elongation factor Ts  59.12 
 
 
307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000816473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1549  elongation factor Ts  58.69 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.406336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3449  elongation factor Ts  57.7 
 
 
308 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.190771  normal  0.488523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0461  elongation factor Ts  55.23 
 
 
307 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1693  elongation factor Ts  54.33 
 
 
310 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.576382 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2034  elongation factor Ts  56.21 
 
 
306 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0653103 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1841  translation elongation factor Ts (EF-Ts)  51.95 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.844303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1695  elongation factor Ts  56.61 
 
 
301 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2348  elongation factor Ts  57.19 
 
 
306 aa  300  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.474929 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2074  elongation factor Ts  57.19 
 
 
306 aa  300  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0812187  normal  0.288352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1511  elongation factor Ts  56.09 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501204  normal  0.0222785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2861  elongation factor Ts  55.45 
 
 
298 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1432  elongation factor Ts  55.45 
 
 
298 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.744073  hitchhiker  0.00915816 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1959  elongation factor Ts  55.41 
 
 
308 aa  276  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2224  elongation factor Ts  51.33 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1370  elongation factor Ts  53.87 
 
 
308 aa  264  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0079  translation elongation factor Ts  48.22 
 
 
294 aa  261  8.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000572472  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1920  translation elongation factor Ts  50 
 
 
303 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1869799999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1862  elongation factor Ts  47.73 
 
 
292 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.981206  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1317  elongation factor Ts  50.98 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0770709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1343  elongation factor Ts  50.98 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00203817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2709  elongation factor Ts  46.89 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.203498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1453  translation elongation factor Ts  47.57 
 
 
292 aa  250  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1496  translation elongation factor Ts  46.41 
 
 
289 aa  248  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0824  elongation factor Ts  48.86 
 
 
292 aa  247  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.343857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1284  elongation factor Ts  49.67 
 
 
294 aa  245  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000149192  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0214  translation elongation factor Ts  47.49 
 
 
292 aa  243  3e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0809  elongation factor Ts  44.19 
 
 
294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1160  elongation factor Ts  46.1 
 
 
293 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2034  elongation factor Ts  46.91 
 
 
294 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0568  elongation factor Ts  46.43 
 
 
293 aa  237  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2478  elongation factor Ts  47.08 
 
 
295 aa  237  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000742116  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0516  elongation factor Ts  41.99 
 
 
288 aa  237  2e-61  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.203151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0658  elongation factor Ts  47.06 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2060  elongation factor Ts  45.19 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3924  elongation factor Ts  46.1 
 
 
295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1142  elongation factor Ts  47.02 
 
 
294 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000657358  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1465  elongation factor Ts  44.3 
 
 
291 aa  233  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.456181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07660  translation elongation factor Ts  48.2 
 
 
299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3867  elongation factor Ts  46.43 
 
 
295 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000442897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3873  elongation factor Ts  46.43 
 
 
295 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000877189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3838  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  232  6e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.61449e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3677  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0354011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3567  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  232  6e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000987514  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3585  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  232  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.425648  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3964  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  232  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000429522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2679  translation elongation factor Ts  44.16 
 
 
310 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000300093  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1161  elongation factor Ts  46.95 
 
 
292 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1445  elongation factor Ts  46.95 
 
 
292 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0721565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1319  elongation factor Ts  46.1 
 
 
295 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000605396  hitchhiker  4.6093e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1678  elongation factor Ts  43.41 
 
 
292 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3649  elongation factor Ts  45.78 
 
 
295 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1672  elongation factor Ts  43.09 
 
 
292 aa  229  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0515  elongation factor Ts  40.93 
 
 
288 aa  228  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0559  elongation factor Ts  47.64 
 
 
292 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1942  translation elongation factor Ts  43.81 
 
 
286 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2980  elongation factor Ts  46.23 
 
 
285 aa  225  8e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1953  elongation factor Ts  45.7 
 
 
303 aa  225  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.055152  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00168  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0115413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3433  translation elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0243528  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01131  elongation factor Ts  45.87 
 
 
292 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0181  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0337912  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0180  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00454958  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3490  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  0.506395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00167  hypothetical protein  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00987131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0174  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152981  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0163  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00406817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0172  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.403994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01373  elongation factor Ts  45.36 
 
 
290 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000291458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1671  elongation factor Ts  45.36 
 
 
303 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000532175  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0257  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  222  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0428296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0239  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0255  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0242  elongation factor Ts  46.36 
 
 
283 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>