More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1280 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1280  translation initiation factor 3  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.453323  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1443  translation initiation factor 3  65 
 
 		 143 aa  189  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000186833  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  46.45 
 
 		 202 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  44.81 
 
 		 190 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  45.73 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  47.93 
 
 		 172 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  43.17 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  47.53 
 
 		 170 aa  150  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  44.26 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  43.72 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  43.72 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  43.72 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  43.72 
 
 		 195 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  43.72 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 166 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  46.01 
 
 		 166 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  43.83 
 
 		 179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1089  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000188384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1384  translation initiation factor IF-3  48.48 
 
 		 176 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000113221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2172  translation initiation factor IF-3  46.67 
 
 		 154 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000864988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  45.96 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000273336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  44.97 
 
 		 173 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  41.76 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  46.48 
 
 		 145 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  42.51 
 
 		 184 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  44.79 
 
 		 164 aa  141  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  40.83 
 
 		 174 aa  141  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  41.44 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  42.53 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1772  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000139127  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1738  translation initiation factor IF-3  48.17 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  40 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  43.11 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1244  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 175 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000317297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  42.33 
 
 		 164 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  43.24 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  40.68 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  40.74 
 
 		 177 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  45.93 
 
 		 173 aa  135  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  46.81 
 
 		 154 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  41.42 
 
 		 175 aa  135  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  42.35 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0802  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  40.37 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  43.21 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0830  translation initiation factor IF-3  44.77 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  42.65 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  42.51 
 
 		 178 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  39.13 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  42.35 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  38.89 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  39.53 
 
 		 173 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  35.94 
 
 		 357 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  41.46 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  43.97 
 
 		 144 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  38.82 
 
 		 176 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1924  translation initiation factor IF-3  43.27 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1858  translation initiation factor IF-3  45.06 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000000644129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0752  translation initiation factor IF-3  43.02 
 
 		 168 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2098  translation initiation factor IF-3  43.97 
 
 		 147 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2019  translation initiation factor IF-3  43.97 
 
 		 147 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0428  translation initiation factor IF-3  42.55 
 
 		 156 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3090  translation initiation factor IF-3  40.41 
 
 		 179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.639467  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  39.87 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  39.13 
 
 		 170 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  43.54 
 
 		 154 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  38.12 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0680  translation initiation factor 3  48.46 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000916638  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  39.73 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20430  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  43.26 
 
 		 155 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  42.54 
 
 		 137 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  37.88 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  39.35 
 
 		 173 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  40.99 
 
 		 182 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  41.84 
 
 		 146 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2146  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 173 aa  126  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000692224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  43.26 
 
 		 180 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  38.51 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  39.86 
 
 		 156 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  39.19 
 
 		 156 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0660  translation initiation factor IF-3  39.75 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000367528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>