48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0724 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  100 
 
 		 149 aa  299  9e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  38.67 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0979  response regulator  42.86 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0417  response regulator  27.52 
 
 		 155 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  23.33 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  32.94 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  30.48 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  28.42 
 
 		 268 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1684  response regulator  32.26 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  27.07 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  36.92 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  26.23 
 
 		 276 aa  49.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  26.62 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00870  response regulator of the LytR/AlgR family  26.42 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  28.83 
 
 		 246 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  25.9 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  23.19 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 272 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  25.25 
 
 		 269 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1401  response regulator receiver protein  38.57 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  26.27 
 
 		 252 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  26.61 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  22.15 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  22.15 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  25 
 
 		 261 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  19.82 
 
 		 258 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 276 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1010  LytTr DNA-binding domain protein  21.88 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  26.73 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  23.64 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  21.33 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  26.88 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  28.3 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01640  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.39 
 
 		 238 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0532  response regulator  32.89 
 
 		 136 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  25.23 
 
 		 275 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  25.24 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.19 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  26.73 
 
 		 260 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  19.15 
 
 		 275 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3116  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 235 aa  40.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  31.58 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  24.27 
 
 		 246 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  24.77 
 
 		 246 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>