36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1966 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  100 
 
 
556 aa  1139    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  51 
 
 
542 aa  558  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  43.94 
 
 
575 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  42.22 
 
 
553 aa  445  1e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.38 
 
 
566 aa  428  1e-118  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.83 
 
 
551 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 
551 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 
572 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 
575 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 
595 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 
590 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 
625 aa  412  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  41.25 
 
 
551 aa  412  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  41.68 
 
 
547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  40.88 
 
 
557 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  38.14 
 
 
556 aa  381  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 
565 aa  380  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 
565 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 
532 aa  372  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 
565 aa  371  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 
565 aa  368  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 
535 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 
515 aa  353  5e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 
510 aa  345  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 
517 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  37.96 
 
 
567 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 
509 aa  317  3e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 
574 aa  45.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  22.48 
 
 
398 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 
451 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
430 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  22.15 
 
 
536 aa  44.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 
471 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>