More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2958 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_15990  DNA topoisomerase IV subunit B  63.21 
 
 		 710 aa  886    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.440467  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13260  DNA topoisomerase IV subunit B  62.66 
 
 		 701 aa  852    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0630779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14380  DNA topoisomerase IV subunit B  61.51 
 
 		 705 aa  860    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219093  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1611  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  67 
 
 		 696 aa  937    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00143665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1674  DNA gyrase subunit B  52.03 
 
 		 730 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.759972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7084  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  66.67 
 
 		 690 aa  905    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1763  DNA topoisomerase IV subunit B  66.52 
 
 		 709 aa  942    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08220  DNA topoisomerase IV subunit B  49.86 
 
 		 701 aa  659    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2134  DNA topoisomerase IV subunit B  66.57 
 
 		 702 aa  959    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3307  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  68.31 
 
 		 701 aa  965    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2280  DNA gyrase subunit B domain protein  50.8 
 
 		 680 aa  642    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.557074  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0298  DNA topoisomerase plasmid partition protein B  51.92 
 
 		 758 aa  755    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1680  DNA topoisomerase type IIA subunit B region 2 domain-containing protein  51.45 
 
 		 702 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.313615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1613  DNA topoisomerase IV subunit B  63.85 
 
 		 702 aa  902    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000263124 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1425  DNA topoisomerase IV subunit B  61.66 
 
 		 723 aa  883    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1534  DNA topoisomerase IV subunit B  65.99 
 
 		 693 aa  900    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.300498  normal  0.0102248 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1988  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  62.32 
 
 		 715 aa  897    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1619  DNA topoisomerase IV subunit B  63.44 
 
 		 702 aa  900    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0681707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1922  DNA topoisomerase IV subunit B  61.69 
 
 		 708 aa  831    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.921776  normal  0.0348119 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1427  DNA topoisomerase IV subunit B  62.74 
 
 		 703 aa  823    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.529913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2394  DNA topoisomerase  68.91 
 
 		 690 aa  924    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.367142  normal  0.572955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2958  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 710 aa  1449    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414962  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2055  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  63.08 
 
 		 713 aa  863    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15910  DNA topoisomerase IV subunit B  61.02 
 
 		 709 aa  872    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.39843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  44.82 
 
 		 648 aa  534  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  42.42 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  43.38 
 
 		 648 aa  526  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  42.77 
 
 		 637 aa  525  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  43.6 
 
 		 665 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  44.17 
 
 		 636 aa  522  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.43 
 
 		 645 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  45.79 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  42.69 
 
 		 642 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  42.8 
 
 		 661 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  41.45 
 
 		 675 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  42.23 
 
 		 632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  43.28 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  44.15 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  44.02 
 
 		 636 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  43.51 
 
 		 633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  43.59 
 
 		 656 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  42.13 
 
 		 650 aa  512  1e-144  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0693  DNA gyrase, B subunit, C-terminal domain protein  54.59 
 
 		 792 aa  515  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  42.46 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  42.21 
 
 		 647 aa  513  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  42.86 
 
 		 633 aa  509  1e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0041  DNA gyrase, B subunit  43.45 
 
 		 691 aa  511  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  43.07 
 
 		 628 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  43.71 
 
 		 650 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 634 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  43.97 
 
 		 640 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  41.27 
 
 		 633 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.62 
 
 		 643 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  43.45 
 
 		 651 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  40.75 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  42.67 
 
 		 644 aa  504  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  42.04 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  43.32 
 
 		 637 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  44.28 
 
 		 650 aa  505  1e-141  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  42.43 
 
 		 644 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  41.53 
 
 		 658 aa  501  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  42.58 
 
 		 643 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  41.88 
 
 		 654 aa  502  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  41.08 
 
 		 644 aa  499  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  44.1 
 
 		 637 aa  495  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  42.65 
 
 		 650 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  41.79 
 
 		 655 aa  498  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  42.02 
 
 		 649 aa  496  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  42.86 
 
 		 649 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  43.67 
 
 		 652 aa  496  1e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  41.43 
 
 		 649 aa  496  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.2 
 
 		 627 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  39.28 
 
 		 655 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  42.33 
 
 		 643 aa  494  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  39.68 
 
 		 655 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  40.15 
 
 		 637 aa  493  9.999999999999999e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  42.34 
 
 		 643 aa  495  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  41.81 
 
 		 642 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1432  DNA gyrase subunit B  42.17 
 
 		 696 aa  495  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  41.73 
 
 		 660 aa  495  9.999999999999999e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  42.16 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  43.02 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  42.69 
 
 		 635 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  44.28 
 
 		 672 aa  493  9.999999999999999e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.01 
 
 		 638 aa  492  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  43.11 
 
 		 661 aa  491  1e-137  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  43.09 
 
 		 649 aa  491  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  42.28 
 
 		 637 aa  490  1e-137  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  40.32 
 
 		 655 aa  492  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  39.86 
 
 		 655 aa  490  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  39.54 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  41.21 
 
 		 655 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  41.06 
 
 		 641 aa  491  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  42.69 
 
 		 642 aa  489  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00060  DNA gyrase subunit B  41.68 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0006  DNA gyrase subunit B  43.44 
 
 		 695 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000061906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  42.58 
 
 		 641 aa  487  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.21 
 
 		 641 aa  488  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  43.34 
 
 		 640 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  39.42 
 
 		 655 aa  489  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>