74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1780 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  100 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  56.72 
 
 		 305 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  49.33 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  47.67 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  42.67 
 
 		 318 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  45.93 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  32.14 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  41.77 
 
 		 320 aa  176  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  38.41 
 
 		 320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  38.61 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  29.75 
 
 		 364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  31.64 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  26.79 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  29.97 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  31.37 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  27.37 
 
 		 426 aa  89.4  8e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  26.59 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  31.25 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  28.3 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.49 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 380 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  32.67 
 
 		 346 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 410 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 402 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.4 
 
 		 363 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 342 aa  49.3  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.17 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  33.14 
 
 		 376 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 365 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  26.51 
 
 		 334 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 376 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  0.00000218413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  32.74 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  31.48 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.21 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43271  predicted protein  21.15 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 374 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  28.25 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  24.83 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  34.78 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  30.61 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  28.67 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  31.86 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  31.86 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  31.86 
 
 		 377 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 378 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 430 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  51.92 
 
 		 404 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  28.67 
 
 		 338 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4831  D-amino acid dehydrogenase small subunit  48 
 
 		 416 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0419861  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>