77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2783 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  39.39 
 
 		 104 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  41.05 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12890  STAS family protein  38.78 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4137  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.78 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5024  hypothetical protein  37.08 
 
 		 102 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57830  hypothetical protein  37.36 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2745  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.03 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4443  STAS domain protein  31.46 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.846038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  35.16 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0880  anti-sigma-factor antagonist  35.96 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.156501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0557  anti-sigma-factor antagonist  34.44 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.102559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  32.14 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3434  anti-sigma-factor antagonist  35.51 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.146418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4532  STAS domain-containing protein  30 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0876  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0907  hypothetical protein  33.72 
 
 		 93 aa  47.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1679  anti-anti-sigma factor RsbV  28.74 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  31.25 
 
 		 106 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0911  anti-sigma B factor antagonist (RsbV)  29.41 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  31.03 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1157  anti sigma b factor antagonist RsbV  29.41 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  27.18 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  26.88 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  28.05 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  30.69 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2098  putative anti-sigma B factor antagonist  29.76 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.74 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3397  NTP binding protein  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  25.42 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3300  anti-sigma-factor antagonist  39.47 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.128319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  25.74 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3254  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.4 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.200949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  26.26 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  29.03 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.05 
 
 		 112 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2044  anti-sigma-factor antagonist  23.16 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000364953  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  29.07 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0337  hypothetical protein  30.95 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215327  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0398  hypothetical protein  30.95 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0346  hypothetical protein  30.95 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0764  anti-sigma-factor antagonist  26.14 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3517  hypothetical protein  30.95 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  29.51 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  29.81 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0241  STAS domain-containing protein  26.79 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.921586  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.681129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  25 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2957  putative signal peptide protein  27.08 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.516221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.27307  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3730  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.302117  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2771  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2999  hypothetical protein  30.95 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2747  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0392  hypothetical protein  35.59 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3566  hypothetical protein  32.2 
 
 		 97 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0915222  hitchhiker  0.0000394569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2765  hypothetical protein  33.96 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  23.91 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 636 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0867  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  33.71 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.991385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2888  putative signal peptide protein  31.82 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  37.5 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0322  hypothetical protein  27.85 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0535747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3235  putative signal peptide protein  30.68 
 
 		 103 aa  40  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.54 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>