208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1456 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  100 
 
 
401 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  55.04 
 
 
409 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  54.22 
 
 
426 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  53.95 
 
 
414 aa  358  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  53.68 
 
 
426 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  53.95 
 
 
434 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  53.12 
 
 
434 aa  349  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  53.13 
 
 
426 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 
404 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 
404 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  53.97 
 
 
424 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  50.66 
 
 
426 aa  315  7e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  53.7 
 
 
424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  50.13 
 
 
407 aa  297  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  45.12 
 
 
426 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  49.21 
 
 
402 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  48.94 
 
 
430 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  46.58 
 
 
426 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  47.3 
 
 
403 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  46.76 
 
 
432 aa  278  9e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0561  cyanate transport system protein CynX, putative  45.33 
 
 
382 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  44.59 
 
 
391 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0043  major facilitator superfamily MFS_1  46.86 
 
 
410 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973221  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0043  major facilitator transporter  49.57 
 
 
459 aa  247  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294091  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  44.25 
 
 
405 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3502  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 
437 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0069474 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  47.61 
 
 
405 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3781  major facilitator transporter  41.9 
 
 
444 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3268  major facilitator transporter  40.21 
 
 
409 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 
413 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1563  major facilitator transporter  42.13 
 
 
403 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0924  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 
424 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.427807  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0902  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 
397 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  41.03 
 
 
404 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  40.73 
 
 
404 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1579  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0385849  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31210  cyanate permease  39.84 
 
 
451 aa  199  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  40.57 
 
 
394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3419  major facilitator transporter  36.54 
 
 
416 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  40.57 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  40.57 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  40.57 
 
 
394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0819  major facilitator transporter  34.18 
 
 
411 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1403  inner membrane transport protein YeaN  40.31 
 
 
394 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.298139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5426  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 
396 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01760  predicted transporter  38.38 
 
 
393 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1852  cyanate transporter  38.38 
 
 
393 aa  193  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.74691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01748  hypothetical protein  38.38 
 
 
393 aa  193  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1877  inner membrane transport protein yeaN  38.38 
 
 
393 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1842  cyanate transporter  38.38 
 
 
393 aa  193  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  31.05 
 
 
396 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2515  inner membrane transport protein yeaN  38.38 
 
 
393 aa  193  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1400  inner membrane transport protein yeaN  38.38 
 
 
393 aa  192  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.226471  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2015  inner membrane transport protein yeaN  38.28 
 
 
393 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00156661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  31.34 
 
 
394 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  37.33 
 
 
409 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2044  inner membrane transport protein yeaN  38.12 
 
 
398 aa  190  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1910  major facilitator transporter  34.7 
 
 
434 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1665  cyanate transporter  37.63 
 
 
395 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3850  major facilitator transporter  37.5 
 
 
406 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1894  permease  33.99 
 
 
403 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0539  major facilitator superfamily MFS_1  39.63 
 
 
361 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.400053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1164  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 
435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  33.33 
 
 
398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2757  major facilitator superfamily protein  39.09 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4340  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 
399 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.459377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
400 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10070  cyanate permease  37.57 
 
 
387 aa  179  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.275202  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1423  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 
428 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  37.14 
 
 
403 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  38.67 
 
 
409 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  36.88 
 
 
403 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  36.88 
 
 
403 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0416  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0712  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 
496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0535724  normal  0.0974758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  38.67 
 
 
409 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1218  major facilitator transporter  36.89 
 
 
436 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  37.61 
 
 
409 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3854  major facilitator transporter  33.68 
 
 
402 aa  169  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  34.73 
 
 
406 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4379  major facilitator transporter  31.07 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785421  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1932  major facilitator transporter  38.84 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.939532  normal  0.256076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  37.43 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3144  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  hitchhiker  0.00799883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5879  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
445 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 
397 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  36.13 
 
 
404 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  34.66 
 
 
409 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  35.29 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2000  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  35.16 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2802  major facilitator transporter  35.19 
 
 
398 aa  152  8.999999999999999e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.110341  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2112  MFS cyanate efflux pump, CynX  31.54 
 
 
436 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3355  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 
423 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.418935 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1184  hypothetical protein  27.79 
 
 
387 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.497488  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22580  cyanate permease  32.4 
 
 
419 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4810  major facilitator superfamily MFS_1  37.75 
 
 
417 aa  147  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2433  major facilitator transporter  30.87 
 
 
439 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  30.42 
 
 
394 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>