143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1341 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1341  carbonic anhydrase  100 
 
 
193 aa  401  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587905  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0910  carbonic anhydrase, putative  79.06 
 
 
192 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.165973  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1529  carbonic anhydrase  73.82 
 
 
193 aa  310  1e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.123592 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1431  carbonic anhydrase  77.49 
 
 
194 aa  308  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.193943  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2619  carbonic anhydrase, putative  73.8 
 
 
192 aa  301  5.000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.358215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2834  carbonic anhydrase  67.54 
 
 
198 aa  295  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130165  normal  0.144825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1891  carbonic anhydrase  70.47 
 
 
193 aa  291  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0910  carbonic anhydrase  67.89 
 
 
197 aa  273  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1333  carbonic anhydrase  49.44 
 
 
165 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.454871  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57799  predicted protein  47.54 
 
 
162 aa  154  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.339062  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0111  carbonic anhydrase-related protein  44.81 
 
 
165 aa  148  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.159855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1310  carbonic anhydrase  45.76 
 
 
165 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2393  carbonic anhydrase  45.56 
 
 
164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.442285  normal  0.447491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3687  carbonic anhydrase  48.75 
 
 
141 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127217  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1800  hypothetical protein  42.7 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.157179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11310  hypothetical protein  44.44 
 
 
163 aa  139  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3284  carbonic anhydrase  40.66 
 
 
163 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3921  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
163 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348754  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3995  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
163 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00734118  normal  0.767989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3936  carbonic anhydrase  41.3 
 
 
163 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186955 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2947  carbonic anhydrase  42.22 
 
 
164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.609065  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2035  carbonic anhydrase  81.01 
 
 
90 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2353  carbonic anhydrase  43.24 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4424  carbonic anhydrase  41.67 
 
 
163 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2270  carbonic anhydrase  40 
 
 
163 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0216  carbonic anhydrase  39.56 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202706  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4355  carbonic anhydrase  41.67 
 
 
163 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2774  carbonic anhydrase  39.44 
 
 
162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2034  carbonic anhydrase  54.29 
 
 
109 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1027  carbonic anhydrase  37.63 
 
 
179 aa  125  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0168514  normal  0.661784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2132  carbonic anhydrase, putative  34.97 
 
 
167 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7083  putative carbonate hydratase  37.29 
 
 
164 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2645  carbonic anhydrase  39.23 
 
 
163 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1601  carbonic anhydrase  39.78 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.972482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1672  carbonic anhydrase  34.44 
 
 
179 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3304  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
175 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2952  carbonic anhydrase  35.39 
 
 
166 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.437593  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0344  carbonic anhydrase  37.08 
 
 
163 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.677491  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35320  carbonic anhydrase  39.39 
 
 
163 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0672264  normal  0.58662 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2390  carbonic anhydrase  31.67 
 
 
166 aa  101  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0603112  normal  0.371663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5906  carbonic anhydrase  34.97 
 
 
192 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46464  normal  0.626114 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4469  carbonic anhydrase  35.14 
 
 
164 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0861  carbonic anhydrase  37.5 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0708  carbonic anhydrase  33.52 
 
 
205 aa  94  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0294  carbonic anhydrase  32.91 
 
 
150 aa  94  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202596  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0544  carbonic anhydrase  34.81 
 
 
150 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0618446  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0609  carbonic anhydrase  33.54 
 
 
150 aa  92  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1375  carbonic anhydrase  34.32 
 
 
157 aa  91.7  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.333229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0579  carbonic anhydrase  32.69 
 
 
150 aa  89  4e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1464  carbonic anhydrase  34.59 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0774  carbonic anhydrase  32.09 
 
 
181 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2322  carbonic anhydrase  34.81 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1887  carbonic anhydrase  33.88 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0207  carbonic anhydrase  32.68 
 
 
172 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.329295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1668  carbonic anhydrase  34.22 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3320  carbonic anhydrase  34.07 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4373  carbonic anhydrase  30.26 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0784956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3273  carbonic anhydrase  30.43 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.694792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0809  carbonic anhydrase, putative  29.67 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.914808  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0014  carbonate dehydratase  32.81 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2168  carbonic anhydrase  29.67 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4911  carbonic anhydrase  32.26 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6172  carbonic anhydrase  28.98 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0885188  decreased coverage  0.000818733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4023  carbonic anhydrase  29.94 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4730  carbonic anhydrase  29.89 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.840642  normal  0.685326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0414  carbonic anhydrase  27.37 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0410  carbonic anhydrase  25.79 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0321  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  25.82 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2767  carbonic anhydrase  30.06 
 
 
182 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4628  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4933  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4948  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4689  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4527  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4912  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4546  carbonic anhydrase; carbonate dehydratase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5049  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4919  putative carbonic anhydrase, prokaryotic type  27.22 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3463  carbonic anhydrase  27.22 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2031  carbonic anhydrase  30.1 
 
 
291 aa  58.2  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0949457  normal  0.0961352 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1254  carbonic anhydrase  26.62 
 
 
180 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000271417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1125  carbonic anhydrase  26.62 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1186  carbonic anhydrase  26.62 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0397  carbonic anhydrase  25.93 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4310  carbonic anhydrase  28.21 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000873696  normal  0.0127245 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4248  carbonic anhydrase  28.21 
 
 
232 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1166  carbonic anhydrase  26.23 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.991497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6172  putative carbonic anhydrase  28.48 
 
 
246 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0800  carbonic anhydrase  27.85 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000181873  normal  0.299491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0779  carbonic anhydrase  26.85 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7305  carbonic anhydrase  28.85 
 
 
234 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0990  twin-arginine translocation pathway signal  32.69 
 
 
243 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0151815  normal  0.34063 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  23.98 
 
 
207 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2753  carbonic anhydrase  27.81 
 
 
236 aa  48.5  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0790  carbonic anhydrase  28.29 
 
 
234 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.518522 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  25.62 
 
 
216 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2569  hypothetical protein  37.7 
 
 
246 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2423  hypothetical protein  37.7 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4750  carbonic anhydrase  27.04 
 
 
239 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5352  carbonic anhydrase  27.09 
 
 
245 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541632  normal  0.601447 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>