More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0589 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  67.73 
 
 		 722 aa  1000    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  66.99 
 
 		 722 aa  1037    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  100 
 
 		 738 aa  1504    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  59.55 
 
 		 746 aa  798    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  56.35 
 
 		 713 aa  783    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  65.11 
 
 		 720 aa  929    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  74.44 
 
 		 716 aa  1125    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  53.2 
 
 		 704 aa  765    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  77.23 
 
 		 716 aa  1169    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.07 
 
 		 712 aa  759    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  67.46 
 
 		 717 aa  1033    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  68.38 
 
 		 722 aa  1050    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  67.86 
 
 		 717 aa  984    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.12 
 
 		 713 aa  881    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  70.81 
 
 		 717 aa  1079    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.99 
 
 		 705 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.81 
 
 		 714 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.16 
 
 		 714 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.92 
 
 		 475 aa  365  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.92 
 
 		 475 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.45 
 
 		 472 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.37 
 
 		 473 aa  354  4e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  40.16 
 
 		 510 aa  353  7e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  42.23 
 
 		 505 aa  352  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  40.81 
 
 		 516 aa  350  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  41.42 
 
 		 515 aa  349  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  40.99 
 
 		 507 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  40.25 
 
 		 510 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.47 
 
 		 486 aa  331  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  38.11 
 
 		 508 aa  328  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  40.46 
 
 		 513 aa  327  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  40.61 
 
 		 525 aa  326  8.000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.83 
 
 		 472 aa  326  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  38.59 
 
 		 507 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  38.74 
 
 		 507 aa  323  6e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.15 
 
 		 482 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.7 
 
 		 494 aa  320  6e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.53 
 
 		 473 aa  319  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40 
 
 		 471 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.66 
 
 		 488 aa  312  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.9 
 
 		 495 aa  312  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.35 
 
 		 515 aa  308  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.96 
 
 		 482 aa  304  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.65 
 
 		 474 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  37.69 
 
 		 509 aa  300  5e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.61 
 
 		 475 aa  293  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.15 
 
 		 480 aa  292  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.53 
 
 		 482 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  36.72 
 
 		 504 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.59 
 
 		 508 aa  289  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  39.14 
 
 		 470 aa  286  9e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.87 
 
 		 484 aa  281  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  37.87 
 
 		 532 aa  276  7e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 		 562 aa  273  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.4 
 
 		 520 aa  272  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  38 
 
 		 472 aa  270  5e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  37.18 
 
 		 557 aa  267  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.9 
 
 		 472 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  34.64 
 
 		 546 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.09 
 
 		 470 aa  262  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  60.09 
 
 		 231 aa  260  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.78 
 
 		 470 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  35.78 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.24 
 
 		 484 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.21 
 
 		 458 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 484 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.55 
 
 		 484 aa  251  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.62 
 
 		 546 aa  249  9e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.21 
 
 		 458 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.26 
 
 		 546 aa  248  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 		 466 aa  248  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  35.98 
 
 		 767 aa  247  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 		 466 aa  246  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 		 481 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  32.8 
 
 		 464 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.02 
 
 		 460 aa  243  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.33 
 
 		 473 aa  243  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  32.34 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  35.71 
 
 		 477 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 		 477 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 		 489 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 473 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  33.48 
 
 		 489 aa  239  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  54.71 
 
 		 236 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  33.83 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 		 459 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  32.67 
 
 		 551 aa  239  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.5 
 
 		 460 aa  238  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35 
 
 		 546 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.19 
 
 		 499 aa  238  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.99 
 
 		 456 aa  238  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  33.12 
 
 		 503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  35.42 
 
 		 745 aa  236  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 		 463 aa  236  8e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  35.43 
 
 		 767 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 		 473 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.35 
 
 		 472 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  59.07 
 
 		 233 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  32.65 
 
 		 548 aa  234  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>