45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2652 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2652  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  654    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0743  hypothetical protein  43.09 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.890074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0987  hypothetical protein  43.05 
 
 
358 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2020  hypothetical protein  40.33 
 
 
260 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2651  hypothetical protein  41.51 
 
 
433 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1677  hypothetical protein  45.2 
 
 
288 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1986  extracellular HAF  33.77 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0338613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  32.23 
 
 
833 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3422  twin-arginine translocation pathway signal  42.98 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1424  extracellular repeat protein, HAF family  29.08 
 
 
386 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000371296 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0067  extracellular repeat protein, HAF family  29.88 
 
 
391 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.899594  normal  0.0302964 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1981  extracellular HAF  33.02 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6689  extracellular HAF  29.86 
 
 
389 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4831  extracellular HAF  29.74 
 
 
428 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0943414  normal  0.0197145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2669  integral membrane protein  36.3 
 
 
392 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.652758  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4152  hypothetical protein  28.38 
 
 
363 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2427  hypothetical protein  39.13 
 
 
231 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0532981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4330  extracellular HAF  34.93 
 
 
264 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0114765  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2382  extracellular repeat protein, HAF family  32.77 
 
 
364 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  36.48 
 
 
2169 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0068  extracellular repeat protein, HAF family  26.07 
 
 
384 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00675708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1803  hypothetical protein  57.58 
 
 
266 aa  50.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0506  hypothetical protein  38.75 
 
 
203 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40604  normal  0.281124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1713  hypothetical protein  62.96 
 
 
270 aa  48.5  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2728  phosphatase-like  54.55 
 
 
462 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.427102  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2338  hypothetical protein  47.5 
 
 
160 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2328  hypothetical protein  42.86 
 
 
181 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1849  extracellular HAF  30.56 
 
 
349 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1800  hypothetical protein  57.58 
 
 
209 aa  46.6  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444481  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1249  hypothetical protein  60.71 
 
 
214 aa  46.2  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.232611  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1593  hypothetical protein  62.5 
 
 
188 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2324  hypothetical protein  57.58 
 
 
201 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2339  hypothetical protein  43.75 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2327  hypothetical protein  48.48 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2005  hypothetical protein  32.99 
 
 
148 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00997836  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2031  hypothetical protein  44 
 
 
179 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0167  hypothetical protein  60 
 
 
239 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0262  hypothetical protein  52.17 
 
 
206 aa  44.3  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000101412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0451  alkaline phosphatase  60.71 
 
 
497 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000822257  normal  0.678086 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1674  hypothetical protein  27.72 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.101851  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0352  hypothetical protein  59.26 
 
 
285 aa  43.5  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.972359  normal  0.0160007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2325  hypothetical protein  68 
 
 
150 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2253  hypothetical protein  62.07 
 
 
248 aa  43.1  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000307297  unclonable  0.000000143416 
 
 
 
NC_007404  Tbd_2252  hypothetical protein  68 
 
 
233 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1067  hypothetical protein  56.67 
 
 
202 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>