More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1232 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 347 aa  717    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2846  periplasmic solute binding protein  49.54 
 
 		 335 aa  324  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 309 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  36.18 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  35.46 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 294 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  35.94 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  34.64 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  31.86 
 
 		 344 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  35.43 
 
 		 291 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  32.75 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  35 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 303 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0916  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 307 aa  149  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  33.56 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  35.84 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 		 326 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  31.18 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  30.64 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1919  periplasmic solute binding protein  29.77 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00461225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  29.41 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  29.69 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  31.03 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.11 
 
 		 333 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  34.77 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2227  periplasmic solute binding protein  29.73 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1207  periplasmic solute binding protein  31.56 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  32.26 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  30.39 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  32.03 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 320 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  29.03 
 
 		 292 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  28.28 
 
 		 301 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 315 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  31.49 
 
 		 307 aa  132  9e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.07 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2630  periplasmic-binding protein  30.94 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00574815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1705  chelated iron ABC transporter, periplasmic iron binding protein YfeA  31.05 
 
 		 311 aa  131  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.86 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.85 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  30.88 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  31.63 
 
 		 309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  30.04 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2211  periplasmic solute binding protein  28.92 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00443052  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.22 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  30.71 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  32 
 
 		 287 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2133  periplasmic solute binding protein  31.83 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.501771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1815  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.566125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30.36 
 
 		 316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1663  putative ABC transporter substrate-binding protein  29.58 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.315809  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0845  periplasmic solute binding protein  33.01 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0688938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  30.36 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0328  chelated iron ABC transporter, periplasmic-binding protein  30.53 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000651268  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  29.27 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  29.27 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2563  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  0.97543 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  30.42 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  29.49 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  30.36 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  30 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  30.42 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  30.36 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  30.42 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3402  periplasmic solute binding protein  28.67 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  29.55 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.72 
 
 		 303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1311  iron chelate ABC transporter, periplasmic iron chelate-binding protein  31.01 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2600  periplasmic solute binding protein  30.42 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  28.32 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0904  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, periplasmic substrate-binding protein SitA  30.5 
 
 		 297 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.785043  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  26.28 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  29.17 
 
 		 294 aa  125  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.44 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  28.82 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  27.06 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1226  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  29.02 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.6 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  30.83 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  30.66 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  30.22 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  32.95 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>