61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1332 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1332  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000172519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1334  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000527962 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1300  hypothetical protein  28.04 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000102355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16290  universal stress protein UspA-like protein  26.03 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000127865  hitchhiker  0.0000372029 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.25 
 
 
208 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  25.17 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  24.83 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  25.5 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  30.16 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  25.85 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.2 
 
 
151 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0711  universal stress protein family  26.53 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0445079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0783  universal stress protein family  26.53 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  26.32 
 
 
750 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0565  universal stress protein  26.53 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0566  universal stress protein  26.53 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0654  universal stress protein  26.53 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0622  universal stress protein  26.53 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0722  universal stress protein  27.63 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0568  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  28.23 
 
 
143 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  30.7 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  30 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  29.79 
 
 
276 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  27.83 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  25 
 
 
288 aa  44.7  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4648  universal stress protein family  26.97 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000011295  unclonable  2.43078e-26 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  26.72 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0690  universal stress protein family  26.85 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0108874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  27.59 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  25.62 
 
 
155 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  26.72 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  27.19 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  22.76 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  24.35 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  21.53 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  26.96 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  26.09 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  25.64 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  24.82 
 
 
146 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  24.82 
 
 
146 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0550  UspA domain-containing protein  25.69 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 
745 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  23.36 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  24.34 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2199  universal stress protein  25.35 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  27.97 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  25.86 
 
 
153 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  29.06 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  25 
 
 
207 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>