More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0376 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  41.27 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  49.38 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0321  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  49.38 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280129  normal  0.293184 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1106  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0674112  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1078  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000063084  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1294  DNA-binding response regulator  36.67 
 
 		 180 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000125664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  37.39 
 
 		 119 aa  72  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4140  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000406755  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  70.9  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  36.52 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4453  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4317  response regulator receiver domain-containing protein  35.9 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.619141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4472  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.685254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.79 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0239  response regulator receiver protein  30.25 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4462  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0286  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.03 
 
 		 228 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  34.82 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4062  response regulator receiver protein  42.68 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259152  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  37.07 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  37.07 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0532  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  40 
 
 		 715 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1404  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3599  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.44 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.955127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  37.07 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  39.22 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0087  transcriptional regulatory protein  30.17 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.701272  normal  0.0818275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 1193 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  36.97 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  32.69 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0989  chemotaxis-specific methylesterase  42.27 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699013 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  38.52 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 886 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  34.19 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.9 
 
 		 890 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0381  two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.638697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  35.29 
 
 		 781 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2025  chemotaxis-specific methylesterase  39.58 
 
 		 349 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1342  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  44.58 
 
 		 361 aa  64.3  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.900228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0440  winged helix family two component transcriptional regulator  30.17 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 235 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.34 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16930  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1343  response regulator receiver protein  35.48 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 810 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4079  sensor histidine kinase/response regulator  36.13 
 
 		 1161 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 235 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  30.7 
 
 		 882 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  41.56 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0985  chemotaxis protein-glutamate methylesterase  39.81 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  30.17 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2741  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000066775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3195  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.595667  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0893  DNA-binding response regulator OmpR  37.39 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0954  two component transcriptional regulator  39.22 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0817018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>