More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2583 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0990  AMP-dependent synthetase and ligase  77.56 
 
 
670 aa  1066    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.274147  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2056  AMP-dependent synthetase and ligase  76.89 
 
 
663 aa  1047    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2583  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
674 aa  1377    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.319993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1328  AMP-dependent synthetase and ligase  85.01 
 
 
694 aa  1212    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1427  AMP-dependent synthetase and ligase  45.69 
 
 
663 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0770781  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1441  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 
642 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.692743  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2222  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 
641 aa  520  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2566  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.83 
 
 
646 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000120954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2333  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.83 
 
 
646 aa  509  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2292  acetate--CoA ligase (acetyl-CoA synthase)  40.4 
 
 
646 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.365139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2554  acetoacetyl-CoA synthase, putative  40.68 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2376  acetoacetyl-CoA synthase  40.52 
 
 
646 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.381353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2517  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.99 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2553  acetoacetyl-CoA synthase  40.52 
 
 
646 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1808  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 
646 aa  505  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00809823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2806  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.68 
 
 
646 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.846139  hitchhiker  0.00209693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2609  putative acetoacetyl-CoA synthase  40.68 
 
 
646 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  40.34 
 
 
650 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  39.94 
 
 
650 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7155  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 
668 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  39.91 
 
 
646 aa  501  1e-140  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0926585  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2113  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 
643 aa  483  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1000  acetate--CoA ligase  37.76 
 
 
653 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0778524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1969  acetyl-CoA synthetase  42.16 
 
 
655 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1637  acetate/CoA ligase  42.16 
 
 
655 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3467  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
670 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0881  acetate/CoA ligase  38.65 
 
 
660 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2831  acetate--CoA ligase  42.18 
 
 
649 aa  463  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0122509 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1195  acetate--CoA ligase  38.31 
 
 
670 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.671297  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0893  acetyl-CoA synthetase  40.97 
 
 
638 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0873  acetate/CoA ligase  40.2 
 
 
655 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.695472 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0664  acetyl-CoA synthetase  38.58 
 
 
667 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3789  acetate/CoA ligase  38.25 
 
 
644 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.670559  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1099  acetate/CoA ligase  38.78 
 
 
700 aa  449  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  37.15 
 
 
666 aa  451  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0597  acetyl-CoA synthetase  38.64 
 
 
657 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1196  acetate--CoA ligase  37.13 
 
 
660 aa  449  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1843  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
666 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  39.04 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 
641 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0265876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  40.55 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0270  acetyl-CoA synthetase  38.92 
 
 
667 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0526  acetate/CoA ligase  38.96 
 
 
649 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0504  acetyl-CoA synthetase  39.59 
 
 
664 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0256  acetyl-CoA synthetase  38.03 
 
 
666 aa  442  1e-123  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.465589  hitchhiker  0.000217461 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1306  acetate/CoA ligase  38.02 
 
 
664 aa  440  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0701  acetate--CoA ligase  38.18 
 
 
638 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1852  acetate/CoA ligase  39.14 
 
 
656 aa  441  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  38 
 
 
655 aa  441  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1302  acetate/CoA ligase  36.09 
 
 
648 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394021  normal  0.0628269 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3543  acetate/CoA ligase  36.85 
 
 
632 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1194  acetate--CoA ligase  36.65 
 
 
659 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0477  acetyl-coenzyme A synthetase  40.51 
 
 
661 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2004  acetate--CoA ligase  37.25 
 
 
639 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00145816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1588  acetate/CoA ligase  37.13 
 
 
651 aa  437  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0074911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3396  acetyl-coenzyme A synthetase  36.85 
 
 
631 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  36.83 
 
 
649 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3461  acetate--CoA ligase  36.66 
 
 
631 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0424007  normal  0.0241789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3479  acetate/CoA ligase  36.85 
 
 
632 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  37.07 
 
 
658 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0380  acetyl-CoA synthetase  39.72 
 
 
668 aa  434  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.153047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0513  acetate/CoA ligase  40.06 
 
 
651 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1254  acetate/CoA ligase  37.15 
 
 
649 aa  435  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00242736  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4043  acetyl-CoA synthetase  39.4 
 
 
715 aa  433  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3168  acetate/CoA ligase  40.3 
 
 
670 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0566588 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1148  acetate--CoA ligase  36.18 
 
 
636 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.39151  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0976  acetate/CoA ligase  37.35 
 
 
659 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3934  acetate--CoA ligase  37.96 
 
 
639 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.118564 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  36.11 
 
 
652 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2604  acetyl-CoA synthetase  35.64 
 
 
664 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  38.9 
 
 
657 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0948  acetyl-CoA synthetase  39.56 
 
 
670 aa  427  1e-118  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18230  acetyl-coenzyme A synthetase  38.39 
 
 
646 aa  427  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.276557  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0211  acetate/CoA ligase  41.02 
 
 
659 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0802  acetate--CoA ligase  37.56 
 
 
636 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.12374  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  36.97 
 
 
673 aa  428  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  36.6 
 
 
653 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0262  acetyl-CoA synthetase  39.09 
 
 
661 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3513  acetyl-CoA synthetase  35.79 
 
 
664 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0665  acetate/CoA ligase  36.99 
 
 
666 aa  425  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509959  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2788  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 
608 aa  424  1e-117  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.374642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36010  acetyl-CoA synthetase  36.42 
 
 
663 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.107334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01080  acetyl-coenzyme A synthetase  37.99 
 
 
650 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  36.83 
 
 
661 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1775  acetate/CoA ligase  37.86 
 
 
667 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4434  acetyl-CoA synthetase  37.66 
 
 
661 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000112496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0550  acetyl-CoA synthetase  39.63 
 
 
663 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.572337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1413  acetate--CoA ligase  36.34 
 
 
656 aa  425  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.243729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3454  acetate--CoA ligase  38.71 
 
 
656 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139628 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3203  acetyl-CoA synthetase  35.78 
 
 
655 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0474974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  36.95 
 
 
657 aa  420  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0873  acetyl-CoA synthetase  38.69 
 
 
657 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1353  acetyl-CoA synthetase  37.76 
 
 
664 aa  421  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000252998  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10301  acetyl-coenzyme A synthetase  35.52 
 
 
658 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96399  normal  0.463217 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0978  acetate/CoA ligase  37.39 
 
 
658 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  35.18 
 
 
656 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3169  acetate/CoA ligase  36.76 
 
 
662 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745528  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1527  acetyl-coenzyme A synthetase  36.96 
 
 
636 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3166  acetate/CoA ligase  36.02 
 
 
648 aa  419  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3887  acetyl-CoA synthetase  35.83 
 
 
657 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>