107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0705 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0705  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.923387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2583  phosphoribosyltransferase  85.33 
 
 
216 aa  377  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0798  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  67.56 
 
 
211 aa  295  4e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2261  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  66.22 
 
 
212 aa  293  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0519341  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2276  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  58.56 
 
 
205 aa  254  6e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4086  phosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
209 aa  226  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.288574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0547  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40.36 
 
 
202 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3471  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  39.11 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.743259  decreased coverage  0.000656001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0089  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  41.33 
 
 
205 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1806  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.73 
 
 
203 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2394  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.98 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.421061 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0772  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.29 
 
 
198 aa  137  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00698153  hitchhiker  0.000000112154 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0272  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
204 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2698  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  35.37 
 
 
206 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0973  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  36.2 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.405367  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1299  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  40 
 
 
206 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1417  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
194 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1091  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  34.91 
 
 
205 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1599  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.24 
 
 
205 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1077  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.24 
 
 
205 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0870  orotate phosphoribosyltransferase-like protein  32.24 
 
 
205 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.200456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0546  orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4012  orotate phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4049  orotate phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000386035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3732  orotate phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.660148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0340  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
231 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0228  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0278  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00941975  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02932  orotate phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
233 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.434684  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0294  orotate phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0234  orotate phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
236 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.960062  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1895  orotate phosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0321  orotate phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
213 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0289  orotate phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90848  orotate phosphoribosyltransferase  25 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001826  orotate phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000690924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2740  orotate phosphoribosyltransferase  29.08 
 
 
213 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0168  orotate phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0786  orotate phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
191 aa  49.3  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.65909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0088  orotate phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00649  orotate phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0041  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.243068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0035  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
225 aa  48.5  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0130  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.556956  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0115  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3478  orotate phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.972793  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2292  orotate phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3928  orotate phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
223 aa  47  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1406  orotate phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
196 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2007  orotate phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
222 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0071  orotate phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
211 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1205  orotate phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0686  orotate phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0097  orotate phosphoribosyltransferase  29.85 
 
 
213 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0812826  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2590  orotate phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.431923  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  26.95 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03499  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0295894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0063  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0139  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0260  orotate phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.379286  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0371  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3487  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0457  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.191717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0370  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3851  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000380668  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4143  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00122436  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0379  orotate phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000579905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0382  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0587643 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0069  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000170079  unclonable  0.00000000943905 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4067  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00621989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0206  orotate phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
169 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5012  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.127395  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0396  orotate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03451  hypothetical protein  29.41 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0214857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4255  orotate phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0122  orotate phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
213 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3672  orotate phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
213 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.145212 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0150  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1618  orotate phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3977  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05884  orotate phosphoribosyltransferase (Eurofung)  29.09 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0195  orotate phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
233 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0912  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0443577  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4846  orotate phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116277  decreased coverage  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0255  orotate phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
212 aa  42.7  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1732  orotate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.35022 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3835  orotate phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0057  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0177997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0051  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4159  orotate phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.041732  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0108  orotate phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 
213 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0895164  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1193  orotate phosphoribosyltransferase  28 
 
 
187 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3603  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3776  orotate phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.851332 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0417  orotate phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
196 aa  42.4  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4013  orotate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62397  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4059  orotate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3932  orotate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0874196  hitchhiker  0.000146436 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4120  orotate phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
213 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0113  orotate phosphoribosyltransferase  27.82 
 
 
221 aa  42  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>