More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0540 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
470 aa  943    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  81.06 
 
 
473 aa  771    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  60.98 
 
 
466 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3935  FAD linked oxidase domain protein  46.3 
 
 
465 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.98 
 
 
463 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  40.76 
 
 
463 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  40.53 
 
 
463 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  40.53 
 
 
463 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.53 
 
 
463 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  40.31 
 
 
463 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.64 
 
 
463 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.56 
 
 
463 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  40.09 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  39.87 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2829  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 
469 aa  332  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  40.4 
 
 
472 aa  332  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
472 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  40.13 
 
 
476 aa  329  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  40.62 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2215  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.31 
 
 
461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00498684  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  40.62 
 
 
472 aa  326  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2162  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.39 
 
 
447 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
469 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.36 
 
 
469 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  43.53 
 
 
453 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  40.36 
 
 
452 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.13 
 
 
469 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  39.69 
 
 
469 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.46 
 
 
469 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.46 
 
 
469 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  40.71 
 
 
471 aa  315  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  40.94 
 
 
454 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.01 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  41.81 
 
 
462 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.09 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  40.53 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  42.79 
 
 
468 aa  312  6.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  38.79 
 
 
471 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  39.24 
 
 
474 aa  311  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.46 
 
 
473 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  40.95 
 
 
469 aa  311  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.22 
 
 
474 aa  311  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.78 
 
 
474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  39.36 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  41.12 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0025  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.55 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.74 
 
 
474 aa  307  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2415  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  40.24 
 
 
469 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576548  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1193  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.24 
 
 
469 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2602  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.24 
 
 
469 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0332  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  40.24 
 
 
469 aa  306  7e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1985  FAD linked oxidase-like  40.33 
 
 
465 aa  305  8.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0845932  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  40.24 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3329  putative glycolate oxidase subunit  40.24 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  40.24 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.45 
 
 
475 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2807  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.37 
 
 
470 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294924  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.56 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  42.52 
 
 
469 aa  303  5.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.8 
 
 
470 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  40.45 
 
 
474 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0780  FAD linked oxidase domain protein  40.18 
 
 
447 aa  302  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.231035  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1410  oxidoreductase, FAD-binding  42.28 
 
 
468 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2526  FAD linked oxidase domain protein  39.33 
 
 
457 aa  301  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1458  FAD linked oxidase domain protein  37.31 
 
 
478 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  40.22 
 
 
474 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2548  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.9 
 
 
470 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.287828  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6133  putative D-lactate dehydrogenase (D-lactate ferricytochrome C oxidoreductase)  40.04 
 
 
473 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  37.37 
 
 
456 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  39.01 
 
 
499 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1366  oxidoreductase, FAD-binding  42.28 
 
 
465 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.866723  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2120  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome), FAD/FMN-containing oxidoreductase  40.14 
 
 
457 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.312623  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1124  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.19 
 
 
488 aa  293  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.945144  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0795  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.67 
 
 
457 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.442237  normal  0.447341 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.48 
 
 
492 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  39.86 
 
 
472 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.72 
 
 
484 aa  292  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09066  D-lactate dehydrogenase (cytochrome) (AFU_orthologue; AFUA_7G02560)  37.02 
 
 
601 aa  291  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0705  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.71 
 
 
457 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3276  FAD linked oxidase-like  38.96 
 
 
472 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.734148  normal  0.868231 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0177  FAD/FMN-containing dehydrogenase  41.09 
 
 
460 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1811  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.33 
 
 
460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.398266  normal  0.215495 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  39.91 
 
 
475 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.48 
 
 
472 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  36.99 
 
 
459 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.95 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.95 
 
 
473 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.6 
 
 
475 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  39.24 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  38.19 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.07 
 
 
457 aa  283  5.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2187  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.29 
 
 
459 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  34.01 
 
 
460 aa  279  8e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.32 
 
 
464 aa  277  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  35.7 
 
 
466 aa  276  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.19 
 
 
482 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  38.21 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  34.76 
 
 
459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  37.16 
 
 
477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>