38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4536 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4536  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 94 aa  191  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1549  type IV pilus assembly PilZ  60 
 
 		 82 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00273376  normal  0.068987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7256  hypothetical protein  57.69 
 
 		 84 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.226268  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2029  type IV pilus assembly PilZ  58.23 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.338028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1523  hypothetical protein  60.26 
 
 		 79 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1720  type IV pilus assembly PilZ  44.3 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.688606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5461  hypothetical protein  43.04 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.392533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3753  type IV pilus assembly PilZ  44.3 
 
 		 79 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.89147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1467  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4663  hypothetical protein  40 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969031  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4372  type IV pilus assembly PilZ  41.77 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5314  type IV pilus assembly PilZ  38.55 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.947891  normal  0.173027 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2398  hypothetical protein  34.88 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2400  hypothetical protein  36.11 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.93992  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7466  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.113392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3752  type IV pilus assembly PilZ  29.47 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4527  type IV pilus assembly PilZ  36.71 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.501407  normal  0.772681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1244  type IV pilus assembly PilZ  39.66 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.192834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2803  type IV pilus assembly PilZ  32.93 
 
 		 131 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4529  type IV pilus assembly PilZ  37.5 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.470833  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3053  type IV pilus assembly PilZ  29.41 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3320  type IV pilus assembly PilZ  30.39 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  37.5 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3553  type IV pilus assembly PilZ  30.12 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.180845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1603  hypothetical protein  31.82 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2644  hypothetical protein  32.5 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3181  type IV pilus assembly PilZ  31.25 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2191  diguanylate cyclase  34.72 
 
 		 417 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3050  type IV pilus assembly PilZ  29.89 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.672808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2135  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.269568 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4321  type IV pilus assembly PilZ  28.42 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.329516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4690  type IV pilus assembly PilZ  28.42 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0169937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7098  type IV pilus assembly PilZ  32.47 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.867442  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2832  hypothetical protein  29.76 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0652  type IV pilus assembly PilZ  34.57 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5566  hypothetical protein  32.1 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4838  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0384  type IV pilus assembly PilZ  29.51 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.892803  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>