More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4427 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  49.15 
 
 		 829 aa  813    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3084  arsenate reductase (azurin)  48 
 
 		 827 aa  780    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4427  arsenate reductase (azurin)  100 
 
 		 820 aa  1714    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  80.49 
 
 		 820 aa  1399    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5678  arsenite oxidase, large subunit  49.39 
 
 		 829 aa  818    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0382  arsenite oxidase, large subunit  36.93 
 
 		 854 aa  521  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000386632  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0377  arsenite oxidase, large subunit  37.88 
 
 		 861 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2365  arsenite oxidase, large subunit  36.43 
 
 		 853 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1369  molydopterin dinucleotide-binding region  29.63 
 
 		 1026 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  25.64 
 
 		 1171 aa  180  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.47 
 
 		 952 aa  178  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25 
 
 		 986 aa  178  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  25.79 
 
 		 931 aa  176  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.06 
 
 		 951 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 954 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 952 aa  173  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.28 
 
 		 951 aa  171  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.16 
 
 		 951 aa  170  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.16 
 
 		 951 aa  170  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.16 
 
 		 951 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.16 
 
 		 951 aa  170  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 		 958 aa  170  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  25.16 
 
 		 951 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  25.16 
 
 		 951 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  25.36 
 
 		 695 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 		 746 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  24.47 
 
 		 746 aa  167  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.89 
 
 		 904 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 		 946 aa  165  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4523  molybdopterin oxidoreductase  24.87 
 
 		 885 aa  162  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 		 955 aa  161  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  24.77 
 
 		 953 aa  160  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.71 
 
 		 894 aa  160  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 724 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.27 
 
 		 906 aa  159  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  24.81 
 
 		 906 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  24.96 
 
 		 908 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 		 686 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  23.5 
 
 		 1003 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  25.17 
 
 		 727 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 1173 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 		 897 aa  153  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  24.27 
 
 		 915 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  24.27 
 
 		 915 aa  151  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.19 
 
 		 905 aa  151  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.95 
 
 		 920 aa  151  5e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.51 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 		 933 aa  148  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  23.62 
 
 		 1180 aa  148  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 		 1188 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  24.65 
 
 		 908 aa  147  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  24.07 
 
 		 689 aa  147  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  22.69 
 
 		 734 aa  147  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  23.23 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1078  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 897 aa  145  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0000348039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  24.7 
 
 		 907 aa  145  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  24.73 
 
 		 901 aa  144  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  25.69 
 
 		 879 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 		 880 aa  143  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  24.09 
 
 		 818 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.65 
 
 		 687 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.64 
 
 		 874 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  25.44 
 
 		 687 aa  141  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 716 aa  141  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.17 
 
 		 677 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5892  nitrate reductase large subunit  25.18 
 
 		 885 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.32137  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.44 
 
 		 766 aa  140  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  23.27 
 
 		 929 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.79 
 
 		 994 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.07 
 
 		 668 aa  139  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  23.27 
 
 		 834 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  25.65 
 
 		 727 aa  139  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.14 
 
 		 688 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  23.56 
 
 		 906 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.3 
 
 		 676 aa  137  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  23.59 
 
 		 896 aa  137  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 		 1313 aa  137  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1219  nitrate reductase large subunit oxidoreductase protein  24.1 
 
 		 913 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.557498  normal  0.256398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  23.66 
 
 		 894 aa  136  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.89 
 
 		 687 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  24.44 
 
 		 706 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.02 
 
 		 676 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  25.24 
 
 		 915 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4449  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 		 870 aa  135  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.28 
 
 		 676 aa  134  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 715 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1627  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 		 885 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169804  normal  0.181312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  24.51 
 
 		 1338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.81 
 
 		 1424 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.84 
 
 		 986 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  23.39 
 
 		 729 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.81 
 
 		 674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 		 621 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.6 
 
 		 907 aa  132  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  24.75 
 
 		 899 aa  132  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 1405 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 1396 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3546  Nitrate reductase  27.06 
 
 		 895 aa  132  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.528678  normal  0.381606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3749  nitrate reductase  24.75 
 
 		 910 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.391081  normal  0.0196621 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3222  nitrate reductase  26.72 
 
 		 895 aa  131  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>