84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3034 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3034  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 440 aa  880    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4054  glycosyl transferase, group 1  47.58 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3900  glycosyl transferase group 1  40.25 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2458  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  23.53 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0817  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0778  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3607  glycosyl transferase group 1  32.17 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0803  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0688317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  22.93 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  24.69 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1012  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0790  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.66 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379704 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  23.95 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 		 441 aa  54.7  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01302  glycosyl transferase, group 1 family protein  20.82 
 
 		 359 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  24.73 
 
 		 367 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.89 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 		 557 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.47 
 
 		 371 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 372 aa  50.8  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 393 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10200  Glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 		 403 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 355 aa  50.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  21.84 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1174  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.97 
 
 		 403 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4411  glycosyl transferase group 1  25.41 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.886505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 425 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25.2 
 
 		 383 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  33.14 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  22.3 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  21.67 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  22.36 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  20.45 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  27.09 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  22.98 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  28.44 
 
 		 407 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  33.62 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  22.14 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12420  glycosyltransferase  29.14 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1095  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0545  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.89 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.49 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0974  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42467  predicted protein  31.85 
 
 		 679 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.486955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  23.53 
 
 		 745 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 392 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2614  glycosyl transferase, group 1  22.51 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201254  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2339  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  22.62 
 
 		 366 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 434 aa  43.9  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  23.84 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  18.25 
 
 		 392 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43286  predicted protein  25.58 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355252  normal  0.0628635 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43238  predicted protein  25.58 
 
 		 456 aa  43.1  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169779  normal  0.020707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  19.76 
 
 		 395 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  22.58 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>