63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2049 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  100 
 
 		 250 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  88.43 
 
 		 244 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  79.67 
 
 		 253 aa  358  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  89.07 
 
 		 262 aa  338  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  87.22 
 
 		 248 aa  326  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  85.87 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  65.25 
 
 		 258 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  44.12 
 
 		 187 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  41.72 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  40.48 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  38.1 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  38.1 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  42.07 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  43.53 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  40.48 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  36.9 
 
 		 205 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  36.9 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  35.71 
 
 		 205 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  36.25 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  34.52 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  34.52 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  32.14 
 
 		 209 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  30.36 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  28.41 
 
 		 205 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  30.95 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  27.59 
 
 		 204 aa  85.9  6e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  26.99 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  26.47 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  26.09 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  25.32 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  25.88 
 
 		 182 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  24.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  28.48 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  22.96 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  24.67 
 
 		 195 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  25.47 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  25.47 
 
 		 198 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3526  invasion associated locus B family protein  24.81 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  22.76 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  24.67 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  24 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  23.94 
 
 		 166 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  26.28 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0778  invasion associated locus B family protein  28.97 
 
 		 187 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000182152  normal  0.361158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  25.51 
 
 		 166 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  23.76 
 
 		 172 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  23.76 
 
 		 191 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  27.87 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  24.49 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  26.52 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  22.77 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  21.78 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3104  invasion associated locus B family protein  22.33 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  29.76 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  19.44 
 
 		 190 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1701  Invasion associated locus B family protein  23.19 
 
 		 212 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154512  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5187  Invasion protein B  27.78 
 
 		 175 aa  42.4  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  23.13 
 
 		 180 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  21.43 
 
 		 177 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5047  invasion associated locus B family protein  25 
 
 		 227 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.413394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  27.55 
 
 		 169 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5774  Invasion associated locus B family protein  27.78 
 
 		 204 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.295733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  23.46 
 
 		 236 aa  42  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>