More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1066 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0552  glycosyl transferase, group 1  84.77 
 
 		 455 aa  793    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1066  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 453 aa  934    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1956  glycosyl transferase group 1  52.11 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3818  glycosyl transferase group 1  52.36 
 
 		 413 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1254  glycosyl transferase group 1  48.01 
 
 		 413 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1625  glycosyltransferase  48.39 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764414  normal  0.185019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2318  glycosyl transferase, group 1  46.06 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1739  glycosyl transferase, group 1  46.13 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1873  glycosyl transferase group 1  48.03 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0530  glycosyl transferase, group 1  47.92 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.307998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0629  glycosyl transferase group 1  46.56 
 
 		 408 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0700  glycosyltransferase  47.68 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0447  hypothetical protein  44.14 
 
 		 412 aa  365  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.607814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2355  glycosyl transferase, group 1  47.68 
 
 		 407 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.359383  normal  0.146668 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21031  glycosyltransferase  41.52 
 
 		 407 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4925  glycosyl transferase, group 1  49.13 
 
 		 409 aa  355  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0559  glycosyl transferase, group 1  43.51 
 
 		 420 aa  352  1e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.34709 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0219  putative glycosyltransferase  44.17 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4003  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 		 406 aa  343  4e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2591  glycosyl transferase group 1  45.79 
 
 		 410 aa  342  1e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1803  glycosyl transferase, group 1  42.71 
 
 		 405 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.143321 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3962  glycosyl transferase group 1  42.41 
 
 		 411 aa  326  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1248  glycosyl transferase group 1  42.93 
 
 		 405 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1356  glycosyl transferase, group 1  41.25 
 
 		 423 aa  319  7.999999999999999e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.699846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0078  glycosyl transferase, group 1  41.26 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.938289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3088  glycosyl transferase, group 1  41.84 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0365  hypothetical protein  42.63 
 
 		 369 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.309757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1893  glycosyl transferase, group 1  40.97 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2888  glycosyl transferase group 1  44.39 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.378477  normal  0.0208188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4715  glycosyl transferase group 1  42.36 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0188107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0503  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 		 403 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3439  glycosyl transferase group 1  39.46 
 
 		 406 aa  293  6e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2766  putative glycosyltransferase  39.37 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2376  glycosyl transferase group 1  39.85 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2683  glycosyl transferase group 1  39.61 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.765474 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01271  glycosyltransferase  40.71 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3858  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 		 417 aa  269  7e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2461  glycosyl transferase group 1  39.64 
 
 		 390 aa  259  6e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0578  glycosyl transferase, group 1  36.32 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.941896  normal  0.221198 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0109  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.927996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0111  glycosyltransferase  34.05 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.451915  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01261  hypothetical protein  27.69 
 
 		 412 aa  167  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0638  glycosyl transferase group 1  29.9 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4431  glycosyl transferase group 1  52.63 
 
 		 188 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4495  glycosyl transferase group 1  52.63 
 
 		 188 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0991  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.56 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  28.91 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2061  glycosyl transferase group 1  24.94 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.35 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17450  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.03 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.792945  normal  0.169163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0108  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4273  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 438 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  25.71 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2645  glycosyl transferase, group 1  34.26 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28.22 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  22.83 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 400 aa  57  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  26.92 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  27.59 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  28.02 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  20.35 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  28.21 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 		 386 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  24.5 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1676  glycosyl transferase, group 1  23.62 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 384 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  25.37 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30040  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.5 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.060295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 756 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.09 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.36 
 
 		 388 aa  54.7  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  24.24 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>