More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0469 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  100 
 
 		 317 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  81.85 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  65.75 
 
 		 295 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0511  HemK family modification methylase  64.51 
 
 		 291 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.076185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0611  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  64.77 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0680432  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0096  HemK family modification methylase  65.07 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0072  HemK family modification methylase  65.26 
 
 		 289 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.794826  normal  0.684454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  54.04 
 
 		 286 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0113  modification methylase, HemK family  55.19 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  54.07 
 
 		 295 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0751  modification methylase HemK  50.37 
 
 		 325 aa  223  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0792044  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  48.33 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  47.57 
 
 		 286 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0138  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  55.07 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513483  normal  0.12084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0825  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  50.88 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.274264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.59 
 
 		 296 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  49.27 
 
 		 292 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  51.59 
 
 		 296 aa  209  5e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1909  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  49.65 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.171628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1748  HemK family modification methylase  46.95 
 
 		 283 aa  202  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1037  HemK family modification methylase  45.39 
 
 		 287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0893  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  51.57 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.615942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1799  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.75 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.207374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1868  hemK protein  42.38 
 
 		 283 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.02 
 
 		 285 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  46.82 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  45.68 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  43.94 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2998  HemK family modification methylase  46.26 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.29427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0139  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.53 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.64075  normal  0.129915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0647  HemK family modification methylase  46.58 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.307152  normal  0.250746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  45.76 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  44.48 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0357  HemK family methyltransferase  35.69 
 
 		 288 aa  182  8.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  38.36 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1732  putative protein methyltransferase  50 
 
 		 274 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3954  protoporphyrinogen oxidase  46.24 
 
 		 293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.12 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  44.89 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  39.43 
 
 		 289 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  37.28 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  38.64 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  39.56 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  38.98 
 
 		 284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  48.18 
 
 		 311 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.12 
 
 		 288 aa  172  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  39.59 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  40.44 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0942  HemK family modification methylase  41.27 
 
 		 278 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.452604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  50.43 
 
 		 280 aa  169  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  39.64 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  45.61 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  39.08 
 
 		 283 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  45.68 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3803  modification methylase, HemK family  40.73 
 
 		 285 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40 
 
 		 285 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  35.27 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.38 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  39.15 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  45.88 
 
 		 283 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  43.07 
 
 		 283 aa  162  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.23 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1651  HemK family modification methylase  42.11 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  44.17 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  41.92 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2062  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.03 
 
 		 277 aa  159  4e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.419255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  35.86 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1551  HemK family modification methylase  45.76 
 
 		 278 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00225309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  38.13 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1063  HemK family modification methylase  31.99 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.273946  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2467  HemK family methyltransferase  34.07 
 
 		 587 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.222509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  41.76 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2177  HemK family modification methylase  34.07 
 
 		 587 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000299232  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  39.38 
 
 		 293 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1608  modification methylase, HemK family protein  37.5 
 
 		 279 aa  157  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0638974  normal  0.595082 
 
 
-
 
NC_002978  WD0010  HemK family modification methylase  30.63 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.175416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  40.98 
 
 		 276 aa  156  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  38.32 
 
 		 289 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  44.15 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  43.27 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40.41 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  42.54 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.28 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  40 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  36.69 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  43.28 
 
 		 286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  36.14 
 
 		 288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0855  modification methylase HemK  32.48 
 
 		 280 aa  153  4e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  40.15 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  39.93 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  48 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2871  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.01 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000102093  hitchhiker  0.0000000000956396 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  40.91 
 
 		 285 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  42.54 
 
 		 286 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2065  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.59 
 
 		 276 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395373  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  46.44 
 
 		 283 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2529  HemK family modification methylase  50.68 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.677433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  44.53 
 
 		 289 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  34.19 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>