34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0397 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0307  Flp pilus assembly protein TadG  76.24 
 
 		 242 aa  314  5e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7023  hypothetical protein  61.58 
 
 		 184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0327836  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3706  TadE-like  50.72 
 
 		 214 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1790  hypothetical protein  48.31 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.499021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4195  TadE family protein  50.52 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3514  TadE-like  49.01 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0225  TadE family protein  34.1 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.523053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0413  hypothetical protein  32.63 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0801  hypothetical protein  27.81 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  26.14 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4199  hypothetical protein  27.33 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.028625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5558  TadE family protein  28.99 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0717  hypothetical protein  25.97 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.611591  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4786  hypothetical protein  25.39 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0555512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4098  hypothetical protein  24.61 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3346  hypothetical protein  26.47 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2390  hypothetical protein  34.13 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.138765  normal  0.0116604 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2978  TadE family protein  28.8 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4182  hypothetical protein  25.32 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2082  TadE family protein  30.14 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0228  hypothetical protein  23.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4862  hypothetical protein  25.52 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.437347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3819  TadE family protein  26.09 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3512  TadE family protein  26.87 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2821  hypothetical protein  27.78 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.458316  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0868  TadE family protein  45.83 
 
 		 277 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5225  TadE family protein  37.04 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.0764086 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  40.43 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  40.43 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  40 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  39.13 
 
 		 164 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  55.56 
 
 		 140 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>