More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5557 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5557  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 327 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.634318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1296  LacI family transcription regulator  61.47 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4934  transcriptional regulator, LacI family  58.84 
 
 		 336 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.129155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2169  transcriptional regulator, LacI family  58.01 
 
 		 337 aa  341  8e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4675  transcriptional regulator, LacI family  56.63 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2988  transcriptional regulator, LacI family  57.06 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1083  transcriptional regulator, LacI family  52.42 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0310257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1191  transcriptional regulator, LacI family  52.13 
 
 		 336 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.218553  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1842  transcriptional regulator, LacI family  52.32 
 
 		 323 aa  275  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10110  transcriptional regulator  49.55 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.625648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1766  transcriptional regulator, LacI family  48.94 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0293304  normal  0.0298236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1322  transcriptional regulator, LacI family  51.52 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0414  regulatory protein LacI  51.52 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1317  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3464  LacI family transcription regulator  41.39 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2612  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 		 342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13620  transcriptional regulator  40.61 
 
 		 333 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6905  transcriptional regulator, LacI family  39.2 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00908765  hitchhiker  0.00367965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3594  transcriptional regulator, LacI family  40.94 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 358 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0384  regulatory protein LacI  38.63 
 
 		 339 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.899866  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1242  LacI family transcription regulator  35.18 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01800  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 341 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4931  transcriptional regulator, LacI family  40.8 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.699714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0183  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 344 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1061  LacI family response repressor  34.37 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.023904  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01470  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17790  transcriptional regulator  42.93 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2354  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 		 344 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0756754  normal  0.112701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.35 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4583  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 343 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0718425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  32.04 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  32.06 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  25.97 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1846  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  27.63 
 
 		 333 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  30.23 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3896  LacI family transcription regulator  31.18 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  34.11 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4882  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0416  LacI family transcription regulator  25.22 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3283  LacI family transcription regulator  32.66 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.815296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.26 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.96 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  30.75 
 
 		 343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  29.19 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  25.3 
 
 		 330 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6022  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  36.36 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4929  LacI family transcription regulator  30.81 
 
 		 346 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33528  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6322  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 337 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  27.3 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1434  transcriptional regulator, LacI family  32.55 
 
 		 338 aa  109  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3199  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.13351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  27.22 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  26.43 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  26.43 
 
 		 332 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  26.93 
 
 		 340 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1876  LacI family transcription regulator  27.67 
 
 		 345 aa  108  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 339 aa  106  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  32.07 
 
 		 334 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.71 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  26.93 
 
 		 343 aa  106  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  26.65 
 
 		 343 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.95 
 
 		 335 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1812  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000564911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5484  LacI family transcription regulator  30.23 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 		 342 aa  103  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.73 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  31.14 
 
 		 350 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  30.65 
 
 		 335 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 		 345 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4580  LacI family transcription regulator  30.99 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000821982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0275  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 339 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.555598 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  30.47 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  30.18 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  30.95 
 
 		 339 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  26.52 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  30.79 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.36 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  30.77 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5204  LacI family transcription regulator  30.67 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>